BENEŠ, Petr, Barbora KOZLÍKOVÁ, Ondřej STRNAD, Vilém ŠUSTR, Eva CHOVANCOVÁ, Antonín PAVELKA, Jan BREZOVSKÝ, Tibor SZABÓ, Matúš ZAMBORSKÝ, Jiří SOCHOR, Jiří DAMBORSKÝ a Lada BIEDERMANNOVÁ. CAVER 2.1. 2010. |
Další formáty:
BibTeX
LaTeX
RIS
|
Základní údaje | |
---|---|
Originální název | CAVER 2.1 |
Název česky | CAVER 2.1 |
Autoři | BENEŠ, Petr (203 Česká republika, domácí), Barbora KOZLÍKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Ondřej STRNAD (203 Česká republika, domácí), Vilém ŠUSTR (203 Česká republika, domácí), Eva CHOVANCOVÁ (203 Česká republika, domácí), Antonín PAVELKA (203 Česká republika, domácí), Jan BREZOVSKÝ (203 Česká republika, domácí), Tibor SZABÓ (703 Slovensko), Matúš ZAMBORSKÝ (703 Slovensko), Jiří SOCHOR (203 Česká republika, garant, domácí), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, domácí) a Lada BIEDERMANNOVÁ (203 Česká republika). |
Vydání | 2010. |
Další údaje | |
---|---|
Originální jazyk | angličtina |
Typ výsledku | Software |
Obor | 10600 1.6 Biological sciences |
Stát vydavatele | Česká republika |
Utajení | není předmětem státního či obchodního tajemství |
WWW | URL |
Kód RIV | RIV/00216224:14330/10:00040637 |
Organizační jednotka | Fakulta informatiky |
Klíčová slova česky | tunel analýza vizualizace |
Klíčová slova anglicky | channel analysis visualization |
Technické parametry | computer program |
Štítky | channel calculation |
Příznaky | Mezinárodní význam |
Změnil | Změnil: RNDr. Ondřej Strnad, Ph.D., učo 139568. Změněno: 31. 10. 2011 12:47. |
Anotace |
---|
CAVER algorithm enables rapid and fully automated calculation of specific pathways called channels in protein molecules. It enables to compute channels in static molecules as well as in molecular dynamics. CAVER is distributed as standalone plugin for PyMOL and also as a part of CAVER Viewer visualization tool. It enables to display computed channels and to perform various subsequent analyses. CAVER Viewer is available as a standalone software or as a Java Web Start application. |
Anotace česky |
---|
CAVER algoritmus umožňuje plně automatizovaný výpočet takzvaných tunelů v molekulách proteinů. Výpočet probíhá jak na statických datech, tak na sekvencích molekulové dynamiky, kdy dochází k automatické detekci daného tunelu v jednotlivých snímcích. CAVER je dostupný jako zásuvný modul pro program PyMOL nebo jako součást aplikace CAVER Viewer. Ta se věnujekromě jiného zejména vizualizaci spočtených tunelů a pomocí různých funkcí umožňuje následnou analýzu takovýchto tunelů. CAVER Viewer je možné získat jako samostatnou aplikaci nebo ve formě Java Web Start na stránkách projektu. |
Návaznosti | |
---|---|
GA201/07/0927, projekt VaV | Název: Vizualizace proteinových struktur |
Investor: Grantová agentura ČR, Vizualice proteinových struktur | |
IAA100040602, projekt VaV | Název: Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace. |
Investor: Akademie věd ČR, Nové přístupy v elektrochemické analýze nukleových kyselin a oligonukleotidů zaměřené na ultrasensitivní mikrodetekci DNA a detekci DNA hybridizace | |
LC06010, projekt VaV | Název: Centrum biokatalýzy a biotransformací |
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biokatalýzy a biotransformací | |
MSM0021622412, záměr | Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL) |
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni | |
MUNI/A/0057/2011, interní kód MU | Název: Posílení zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity (Akronym: SKONF) |
Investor: Masarykova univerzita, Posílení zapojení studentů Fakulty informatiky do mezinárodní vědecké komunity, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty |
VytisknoutZobrazeno: 20. 9. 2024 22:33