a 2010

Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Darina ČEJKOVÁ; Michal STROUHAL; Petra POSPÍŠILOVÁ; G.M. WEINSTOCK et al.

Základní údaje

Originální název

Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.

Autoři

ZOBANÍKOVÁ, Marie; Darina ČEJKOVÁ; Michal STROUHAL; Petra POSPÍŠILOVÁ; G.M. WEINSTOCK a David ŠMAJS

Vydání

25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Slovensko

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova česky

syfilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; celogenomové sekvencování

Klíčová slova anglicky

syphilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; whole genome sequencing
Změněno: 19. 1. 2011 14:41, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Anotace

V originále

Tropické kožní onemocnění yaws a sexuálně i kongenitálně přenosné onemocnění syfilis jsou přes odlišné klinické projevy způsobeny stejným bakteriálním druhem Treponema pallidum. Původcem yaws je poddruh pertenue (TPE) a původcem syfilis je poddruh pallidum (TPA). Poddruhy nelze morfologicky, sérologicky ani imunologicky odlišit. Byly sekvencovány 3 genomy TPE (kmeny Samoa D, CDC-2 a Gauthier). Navržené geny kmenů TPE byly porovnány s geny 3 kmenů TPA (Nichols, SS14 a DAL-1). Mezi TPE a TPA bylo nalezeno více než 1200 změn v DNA (jednonukleotidové substituce a indely a vícenukleotidové indely). Změny v DNA se projevily více než 570 aminokyselinovými změnami ve 286 proteinech anotovaných u TPE i TPA. Z toho pouze 92 genů (9 % ze všech anotovaných genů) kódovalo proteiny obsahující 2 a více aminokyselinových změn nebo posun čtecího rámce. Porovnáním celogenomových sekvencí TPA a TPE kmenů byly vytipovány geny, jež se mohou podílet na rozdílných klinických projevech syfilis a yaws, jejich funkce však zatím zůstává převážně neznámá.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů