ZOBANÍKOVÁ, Marie, Darina ČEJKOVÁ, Michal STROUHAL, Petra POSPÍŠILOVÁ, G.M. WEINSTOCK a David ŠMAJS. Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue. In 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Treponema pallidum: celogenomové rozdíly mezi poddruhy pallidum a pertenue.
Autoři ZOBANÍKOVÁ, Marie, Darina ČEJKOVÁ, Michal STROUHAL, Petra POSPÍŠILOVÁ, G.M. WEINSTOCK a David ŠMAJS.
Vydání 25. Kongres Československé společnosti mikrobiologické. 2010.
Další údaje
Originální jazyk čeština
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor Genetika a molekulární biologie
Stát vydavatele Slovensko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Lékařská fakulta
Klíčová slova česky syfilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; celogenomové sekvencování
Klíčová slova anglicky syphilis; yaws; Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; whole genome sequencing
Změnil Změnila: Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D., učo 177725. Změněno: 19. 1. 2011 14:41.
Anotace
Tropické kožní onemocnění yaws a sexuálně i kongenitálně přenosné onemocnění syfilis jsou přes odlišné klinické projevy způsobeny stejným bakteriálním druhem Treponema pallidum. Původcem yaws je poddruh pertenue (TPE) a původcem syfilis je poddruh pallidum (TPA). Poddruhy nelze morfologicky, sérologicky ani imunologicky odlišit. Byly sekvencovány 3 genomy TPE (kmeny Samoa D, CDC-2 a Gauthier). Navržené geny kmenů TPE byly porovnány s geny 3 kmenů TPA (Nichols, SS14 a DAL-1). Mezi TPE a TPA bylo nalezeno více než 1200 změn v DNA (jednonukleotidové substituce a indely a vícenukleotidové indely). Změny v DNA se projevily více než 570 aminokyselinovými změnami ve 286 proteinech anotovaných u TPE i TPA. Z toho pouze 92 genů (9 % ze všech anotovaných genů) kódovalo proteiny obsahující 2 a více aminokyselinových změn nebo posun čtecího rámce. Porovnáním celogenomových sekvencí TPA a TPE kmenů byly vytipovány geny, jež se mohou podílet na rozdílných klinických projevech syfilis a yaws, jejich funkce však zatím zůstává převážně neznámá.
Návaznosti
GA310/07/0321, projekt VaVNázev: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměrNázev: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaVNázev: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
VytisknoutZobrazeno: 19. 9. 2024 20:20