a 2010

Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

MIKALOVÁ, Lenka; Michal STROUHAL a David ŠMAJS

Základní údaje

Originální název

Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

Vydání

54. Studentská vědecká konference LF MU, 2010

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

Genetika a molekulární biologie

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ne

Organizační jednotka

Lékařská fakulta

Klíčová slova česky

Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; syfilis; yaws; Fribourg-Blanc
Změněno: 19. 1. 2011 21:20, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Anotace

V originále

Rod Treponema zahrnuje několik druhů a poddruhů patogenních spirochet. Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je obligátním patogenem člověka a způsobuje pohlavně přenosnou systémovou infekci s celosvětovým výskytem, označovanou jako syfilis. Mezi klinicky významné poddruhy patří i původce nevenerického onemocnění yaws Treponema pallidum subsp. pertenue (TPE), s charakteristickým výskytem v tropických oblastech. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet je způsobena rozdíly v jejich genomech. Pro celogenomové restrikční mapování (WGF) byly použity 3 kmeny poddruhu T. p. pallidum (DAL-1, SS14 a Mexico A), 3 kmeny poddruhu T. p. pertenue (Gauthier, CDC-2 a Samoa D) a dosud taxonomicky nezařazený kmen T. pallidum Fribourg-Blanc izolovaný z paviána. Genomy všech studovaných kmenů byly rozděleny na základě referenční sekvence kmene T. pallidum subsp. pallidum Nichols do 133 překrývajících se intervalů (TPI intervalů. TPI intervaly byly štěpeny restrikčními endonukleázami. I přes vysokou sekvenční shodu jednotlivých poddruhů pallidum a pertenue, lze tyto poddruhy odlišit na základě 6 genomových oblastí, kde se nachází sekvenční změny ve formě indelů v rozmezí velikostí 38 – 635 bp. Detekovaných změn lze využít v molekulární diagnostice onemocnění yaws a syfilis, především v oblastech, kde se obě tato onemocnění vyskytují současně. Sérologická neodlišitelnost treponemálních původců yaws a syfilis totiž výrazně komplikuje klinickou diagnostiku těchto onemocnění.

Návaznosti

GA310/07/0321, projekt VaV
Název: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Grantová agentura ČR, Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
NR8967, projekt VaV
Název: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů