a 2010

Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

MIKALOVÁ, Lenka, Michal STROUHAL and David ŠMAJS

Basic information

Original name

Identifikace genetických rozdílů mezi původci yaws a syfilis.

Authors

Edition

54. Studentská vědecká konference LF MU, 2010

Other information

Language

Czech

Type of outcome

Konferenční abstrakt

Field of Study

Genetics and molecular biology

Country of publisher

Czech Republic

Confidentiality degree

není předmětem státního či obchodního tajemství

Organization unit

Faculty of Medicine

Keywords (in Czech)

Treponema pallidum subsp. pallidum; Treponema pallidum subsp. pertenue; syfilis; yaws; Fribourg-Blanc
Změněno: 19/1/2011 21:20, Mgr. Marie Zobaníková, Ph.D.

Abstract

V originále

Rod Treponema zahrnuje několik druhů a poddruhů patogenních spirochet. Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) je obligátním patogenem člověka a způsobuje pohlavně přenosnou systémovou infekci s celosvětovým výskytem, označovanou jako syfilis. Mezi klinicky významné poddruhy patří i původce nevenerického onemocnění yaws Treponema pallidum subsp. pertenue (TPE), s charakteristickým výskytem v tropických oblastech. Lze předpokládat, že různá míra invazivity a patogenity těchto spirochet je způsobena rozdíly v jejich genomech. Pro celogenomové restrikční mapování (WGF) byly použity 3 kmeny poddruhu T. p. pallidum (DAL-1, SS14 a Mexico A), 3 kmeny poddruhu T. p. pertenue (Gauthier, CDC-2 a Samoa D) a dosud taxonomicky nezařazený kmen T. pallidum Fribourg-Blanc izolovaný z paviána. Genomy všech studovaných kmenů byly rozděleny na základě referenční sekvence kmene T. pallidum subsp. pallidum Nichols do 133 překrývajících se intervalů (TPI intervalů. TPI intervaly byly štěpeny restrikčními endonukleázami. I přes vysokou sekvenční shodu jednotlivých poddruhů pallidum a pertenue, lze tyto poddruhy odlišit na základě 6 genomových oblastí, kde se nachází sekvenční změny ve formě indelů v rozmezí velikostí 38 – 635 bp. Detekovaných změn lze využít v molekulární diagnostice onemocnění yaws a syfilis, především v oblastech, kde se obě tato onemocnění vyskytují současně. Sérologická neodlišitelnost treponemálních původců yaws a syfilis totiž výrazně komplikuje klinickou diagnostiku těchto onemocnění.

Links

GA310/07/0321, research and development project
Name: Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum
Investor: Czech Science Foundation
MSM0021622415, plan (intention)
Name: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministry of Education, Youth and Sports of the CR, Molecular basis of cell and tissue regulations
NR8967, research and development project
Name: Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
Investor: Ministry of Health of the CR