J 2011

Metabolomika – základní pojmy, strategie a metodologie

MUSILOVÁ, Jindra a Zdeněk GLATZ

Základní údaje

Originální název

Metabolomika – základní pojmy, strategie a metodologie

Název česky

Metabolomika – základní pojmy, strategie a metodologie

Název anglicky

Metabolomics – basic concepts, strategies and methodologies.

Autoři

MUSILOVÁ, Jindra (203 Česká republika, domácí) a Zdeněk GLATZ (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Chemické listy, Praha (Czech Republic), Česká společnost chemická, 2011, 0009-2770

Další údaje

Jazyk

čeština

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 0.529

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00049754

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

UT WoS

000296266700003

Klíčová slova česky

metabolomika, metabolom, metabolismus, nukleární magnetická rezonance, hmotnostní spektrometrie, plynová chromatografie, kapalinová chromatografie, kapilární elektroforéza

Klíčová slova anglicky

metabolomics; metabolome; metabolism; NMR; MS; GS; HPLC; CE

Štítky

Změněno: 21. 1. 2014 15:05, prof. RNDr. Zdeněk Glatz, CSc.

Anotace

V originále

Metabolomika, t.j. komplexní analýza metabolomu za konkrétního fyziologického nebo vývojového stádia organismu, tkáně či buňky, je důležitá zejména z důvodu porozumění buněčných funkcí, jelikož na rozdíl od jiných tzv. „omik“ více odráží aktuální stav buňky, který je vysoce dynamický7. Hladina metabolitů, čili metabolický „pool“, přitom není odpověď pouze genové exprese, ale i environmentálního a vývojového stimulu nebo důsledek genetické mutace. Metabolity a jejich koncentrace tedy musí být monitorovány jak prostorově, tak i časově. Nelze porozumět dynamickému chování metabolismu bez znalosti typů a množství jednotlivých sloučenin, které se vyskytují v žijících organismech či buňkách za různých podmínek5. Protože jednotlivé „omiky“ nepostačují na pochopení buněčné fyziologie a regulačních mechanismů, stále častěji se využívá jejich kombinovaná analýza, která je podstatou v současné době velmi rychle se rozvíjející vědní disciplíny – systémové biologie.

Anglicky

This review defines the term “metabolomics” and clarifies its history and significance. The different strategies of metabolomics research are described together with their main application fields. Then the review focuses on the ways of sample preparations and on the analytical methodologies that are most frequently used for metabolomic studies - NMR, MS, GC/MS, HPLC/MS and CE/MS. Practical importance of metabolomics and its role in the systems biology are mentioned as well.

Návaznosti

GAP206/11/0009, projekt VaV
Název: Kapilární electroforéza jako nástroj pro metabolomické studie (Akronym: CE metabolomics)
Investor: Grantová agentura ČR, Capillary electrophoresis as a member of the metabolomic analytical toolbox
LC06023, projekt VaV
Název: Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Integrované bioanalytické technologie pro mikroanalýzy a diagnostiku s využitím LIF a hmotnostní spektrometrie
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím