J 2011

Sample preparation methods for MALDI-MS profiling of bacteria

ŠEDO, Ondrej, Ivo SEDLÁČEK a Zbyněk ZDRÁHAL

Základní údaje

Originální název

Sample preparation methods for MALDI-MS profiling of bacteria

Název česky

Metody přípravy vzorku pro MALDI-MS profilování bakterií

Autoři

ŠEDO, Ondrej (203 Česká republika, domácí), Ivo SEDLÁČEK (203 Česká republika, domácí) a Zbyněk ZDRÁHAL (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Mass Spectrometry Reviews, Wiley-Blackwell, 2011, 0277-7037

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10406 Analytical chemistry

Stát vydavatele

Spojené státy

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 10.461

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00052198

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

UT WoS

000289532100004

Klíčová slova česky

MALDI MS; profilování bakterií; identifikace mikroorganismů

Klíčová slova anglicky

MALDI-MS; bacteria profiling; microorganism identification

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 7. 4. 2012 05:38, Olga Křížová

Anotace

V originále

Direct matrix-assisted laser desorption/ionization mass spec- trometry (MALDI-MS) bacterial cell or lysate analysis appears to meet all the criteria required for a rapid and reliable analytical microorganism identification and taxonomical classification tool. Few-minute analytical procedure providing information extending up to sub-species level underlines the potential of the MALDI-MS profiling in comparison with other methods employed in the field. However, the quality of MALDI-MS profiles and consequently the performance of the method are influenced by numerous factors, which involve particular steps of the sample preparation procedure. This review is aimed at advances in development and optimization of the MALDI-MS profiling methodology. Approaches improving the quality of the MALDI-MS profiles and universal feasibility of the method are discussed.

Česky

Přímá analýza celých buněk či jejich lyzátů hmotnostní spektrometrií s laserovou desorpcí a ionizací za účasti matrice (MALDI MS) splňuje všechna kritéria pro rychlou a spolehlivou metodu identifikace a taxonomické klasifikace mikroorganismů. Několikaminutová příprava vzorku vedoucí k získání infomace až na úrovni poddruhu podtrhuje význam MALDI MS ve srovnání s dalšími v této oblasti používanými metodami. Kvalita MALDI MS dat a z ní plynoucí diskriminační schopnosti metody jsou ovlivněny mnoha mnoha faktory, které zahrnují jednotlivé kroky přípravy vzorku. Tato review se zaměřuje na možné varianty a optimalizaci přípravy vzorku pro MALDI MS profilování. Diskutovány jsou především přístupy zlepšující vlastnosti MALDI hmotnostních spekter a tím i použitelnost metody.

Návaznosti

LC06034, projekt VaV
Název: Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Regulace morfogeneze rostlinných buněk a orgánů
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase