R 2010

E-photosynthesis: web software for modeling and analysis of biological processes behind photosynthesis

KLEMENT, Matej; David ŠAFRÁNEK; Jan ČERVENÝ; Luboš BRIM; Ladislav NEDBAL et. al.

Základní údaje

Originální název

E-photosynthesis: web software for modeling and analysis of biological processes behind photosynthesis

Název česky

E-photosynthesis: webový software pro modelování a analýzu biologických procesů fotosyntézy

Autoři

KLEMENT, Matej (703 Slovensko, domácí); David ŠAFRÁNEK (203 Česká republika, garant, domácí); Jan ČERVENÝ (203 Česká republika); Luboš BRIM (203 Česká republika, domácí) a Ladislav NEDBAL (203 Česká republika)

Vydání

2010

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Software

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Kód RIV

RIV/00216224:14330/10:00047901

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

systems biology; photosynthesis; database; annotation; SBML

Technické parametry

RNDr. David Šafránek, Ph.D., email: safranek@fi.muni.cz
Změněno: 29. 4. 2011 10:46, doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Anotace

V originále

E-photosynthesis is a web software for maintanance, annotation, browsing and analysis of differential computational models representing biochemical and biophysical processes underlying photosynthesis. Software allows visualization of models, precise annotation of biological terms related to models, model creation from predefined module templates, model manipulation and basic simulation of model dynamics. Models can be exported in terms of standard format files reflecting SBML level 2. Application is composed from the front-end part -- the PHP-based web user interface, and the back-end part -- the MySQL database and simulation software.

Návaznosti

GA201/09/1389, projekt VaV
Název: Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy