Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA

VOGEL, Ivan; František ZEDEK a Pavel OČENÁŠEK. Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA. In Lecture Notes in Computer Science. Berlin Heidelberg: Springer Verlag, 2011, s. 165-169. ISBN 978-3-642-21792-0. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/978-3-642-21793-7_20.

Základní údaje

Originální název

Constructing Phylogenetic Trees Based on Intra-Group Analysis of Human Mitochondrial DNA

Název česky

Konstrukce fylogenetických stromů založená na vnitroskupinové analýze lidské mitochondriální DNA

Autoři

VOGEL, Ivan; František ZEDEK a Pavel OČENÁŠEK

Vydání

Berlin Heidelberg, Lecture Notes in Computer Science, od s. 165-169, 5 s. 2011

Nakladatel

Springer Verlag

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Stať ve sborníku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Německo

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Forma vydání

tištěná verze "print"

Impakt faktor

Impact factor: 0.402 v roce 2005

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00073369

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-3-642-21792-0

ISSN

DOI

https://doi.org/10.1007/978-3-642-21793-7_20

Klíčová slova česky

Intra-group; mtDNA; neighbor joining; Phylogenetic trees; population divergence; position-specific clustering vector; substitution model

Klíčová slova anglicky

Intra-group; mtDNA; neighbor joining; Phylogenetic trees; population divergence; position-specific clustering vector; substitution model

Štítky

AKR, rivok

---

Anotace

V originále

This paper describes a modified algorithm for inferring phylogenetic trees based on distance techniques. The input of the algorithm consists of predefined clusters of data. It uses a usual agglomerative approach, however it involves a novel technique for distance matrix creation as the task of clustering predefined groups of human mitochondrial DNA sequences should be fulfilled.

---

Návaznosti

GA206/09/1405, projekt VaV	Název: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
LC06073, projekt VaV	Název: Centrum pro výzkum biodiverzity Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr	Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase