Současné trendy v analýze genomických dat

BUDINSKÁ, Eva, Zbyněk BORTLÍČEK a Ladislav DUŠEK. Současné trendy v analýze genomických dat. Lékař a technika. roč. 2011. ISSN 0301-5491. 2011.

Základní údaje

• Originální název: Současné trendy v analýze genomických dat
• Název anglicky: Current trends in genomic data analysis
• Autoři: BUDINSKÁ, Eva, Zbyněk BORTLÍČEK a Ladislav DUŠEK.
• Vydání: Lékař a technika, 2011, 0301-5491.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 30000 3. Medical and Health Sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova česky: genomický experiment, zpracování dat, mikročip, sekvenování
• Klíčová slova anglicky: genomic experiment, data processing, microchip, sequencing

Anotace

Současný biologický a medicínský výzkum se dostal do stádia, kdy pochopení komplexních procesů stojících za fenotypovou variabilitou studovaných entit (bakteriálních kmenů, buněčných populací, jedinců, nemocí nebo celých živočišných druhů) je jednoznačně determinováno znalostí genomu, proteomu a mechanismů řídících jejich vzájemnou regulaci a interakce. Moderní a vysoce výkonné technologie, jakými jsou mikročipy nebo sekvenační metody nové generace, produkují velké množství komplexních dat, pro jejichž skladování a analýzu je nutná aplikace a vývoj speciálních bioinformatických nástrojů a statistických postupů. Neustálé zdokonalování těchto technologií představuje permanentní výzvu mnoha oborům, zejména bioinformatice a biostatistice. Tento článek si klade za cíl poskytnout ucelený přehled současných trendů v analýze genomických dat z pohledu bioinformatiky. Práce se také krátce zabývá dostupností těchto technologií v současné klinické praxi a výzkumu.

Anotace anglicky

Current biological and medical research has become into the stage, in which understanding of complex processes standing behind the phenotypic variability of investigated entities (bacterial strains, cell populations, individuals, diseases, or animal species) is unambiguously determined by knowledge of genome and proteome and mechanisms behind their mutual regulation and interactions. Modern high-throughput technologies, such as microchips or new generation sequencing methods, produce a high amount of complex data, which requires warehousing and analysis with application and development of special bioinformatics tools and statistical methodologies. This consists particularly in continuous improvement of these technologies, which represents a permanent challenge for many disciplines, namely bioinformatics and biostatistics. This article aims to provide a short overview of current trends in the genomic data analysis in light of bioinformatics. The article also briefly discusses the accessibility of the modern technologies in current clinical practice and research.