J 2011

Reachability in Biochemical Dynamical Systems by Quantitative Discrete Approximation

BRIM, Luboš; Jana FABRIKOVÁ; Sven DRAŽAN a David ŠAFRÁNEK

Základní údaje

Originální název

Reachability in Biochemical Dynamical Systems by Quantitative Discrete Approximation

Autoři

Vydání

Electronic Proceedings in Theoretical Computer Science, 2011, 2075-2180

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14330/11:00049903

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

DOI

UT WoS

Klíčová slova anglicky

abstraction; differential equations; reachability; systems biology

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 11. 4. 2012 10:22, doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D.

Anotace

V originále

In this paper a novel computational technique for finite discrete approximation of continuous dynamical systems suitable for a significant class of biochemical dynamical systems is introduced. The method is parameterized in order to affect the imposed level of approximation provided that with increasing parameter value the approximation converges to the original continuous system. By employing this approximation technique, we present algorithms solving the reachability problem for biochemical dynamical systems. The presented method and algorithms are evaluated on several exemplary biological models and on a real case study.

Návaznosti

GA201/09/1389, projekt VaV
Název: Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů
Investor: Grantová agentura ČR, Verifikace a analýza velmi velkých počítačových systémů
MSM0021622419, záměr
Název: Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy
MUNI/A/0914/2009, interní kód MU
Název: Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace (Akronym: SV-FI MAV)
Investor: Masarykova univerzita, Rozsáhlé výpočetní systémy: modely, aplikace a verifikace, DO R. 2020_Kategorie A - Specifický výzkum - Studentské výzkumné projekty