Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands

STSIAPANAVA, Alena, Radka CHALOUPKOVÁ, Andrea FOŘTOVÁ, J. BRYNDA, M. S. WEISS, Jiří DAMBORSKÝ a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ. Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands. Acta Crystallographica F. 2011, roč. 67, č. 67, s. 253-257. ISSN 1744-3091. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1107/S1744309110051286.

Základní údaje

• Originální název: Crystallization and Preliminary X-ray Diffraction Analysis of the Wild-Type Haloalkane Dehalogenase DhaA and its Variant DhaA13 Complexed with Different Ligands
• Autoři: STSIAPANAVA, Alena (112 Bělorusko, domácí), Radka CHALOUPKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Andrea FOŘTOVÁ (203 Česká republika, domácí), J. BRYNDA (203 Česká republika), M. S. WEISS (203 Česká republika), Jiří DAMBORSKÝ (203 Česká republika, garant, domácí) a Ivana KUTÁ-SMATANOVÁ (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: Acta Crystallographica F, 2011, 1744-3091.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Velká Británie a Severní Irsko
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Impakt faktor: Impact factor: 0.506
• Kód RIV: RIV/00216224:14310/11:00049440
• Organizační jednotka: Přírodovědecká fakulta
• Doi: http://dx.doi.org/10.1107/S1744309110051286
• UT WoS: 000287030600018
• Klíčová slova anglicky: Crystallization; X-ray Diffraction Analysis; Haloalkane Dehalogenase DhaA
• Štítky: AKR, rivok

Anotace

Haloalkane dehalogenases make up an important class of hydrolytic enzymes which catalyse the cleavage of carbon-halogen bonds in halogenated aliphatic compounds. There is growing interest in these enzymes owing to their potential use in environmental and industrial applications. The haloalkane dehalogenase DhaA fromRhodococcus rhodochrous NCIMB 13064 can slowly detoxify the industrial pollutant 1,2,3-trichloropropane (TCP). Structural analysis of this enzyme complexed with target ligands was conducted in order to obtain detailed information about the structural limitations of its catalytic properties. In this study, the crystallization and preliminary X-ray analysis of complexes of wild-type DhaA with 2-propanol and with TCP and of complexes of the catalytically inactive variant DhaA13 with the dye coumarin and with TCP are described.

Návaznosti

• ED0001/01/01, projekt VaV: Název: CETOCOEN
• IAA401630901, projekt VaV: Název: Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami

Investor: Akademie věd ČR, Evoluce substrátové specifity u enzymů aktivních s xenobiotickými látkami

• LC06010, projekt VaV: Název: Centrum biokatalýzy a biotransformací

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum biokatalýzy a biotransformací

• MSM0021622412, záměr: Název: Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální, regionální a lokální úrovni (INCHEMBIOL) (Akronym: INCHEMBIOL)

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Interakce mezi chemickými látkami, prostředím a biologickými systémy a jejich důsledky na globální , regionální a lokální úrovni

• MSM0021622413, záměr: Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím