Dispersion interactions of carbohydrates with condensate aromatic moieties: Theoretical study on the CH–pi interaction additive properties

KOZMON, Stanislav, Radek MATUŠKA, Vojtech SPIWOK a Jaroslav KOČA. Dispersion interactions of carbohydrates with condensate aromatic moieties: Theoretical study on the CH–pi interaction additive properties. Physical Chemistry Chemical Physics. Great Britain: ROYAL SOC CHEMISTRY, 2011, roč. 13, č. 31, s. 14215-14222. ISSN 1463-9076. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/c1cp21071h.

Základní údaje

• Originální název: Dispersion interactions of carbohydrates with condensate aromatic moieties: Theoretical study on the CH–pi interaction additive properties
• Autoři: KOZMON, Stanislav (703 Slovensko, domácí), Radek MATUŠKA (203 Česká republika, domácí), Vojtech SPIWOK (203 Česká republika) a Jaroslav KOČA (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: Physical Chemistry Chemical Physics, Great Britain, ROYAL SOC CHEMISTRY, 2011, 1463-9076.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Článek v odborném periodiku
• Obor: 10403 Physical chemistry
• Stát vydavatele: Velká Británie a Severní Irsko
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Impakt faktor: Impact factor: 3.573
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/11:00049968
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• Doi: http://dx.doi.org/10.1039/c1cp21071h
• UT WoS: 000293172300036
• Klíčová slova anglicky: SMALL MOLECULAR-INTERACTIONS; DENSITY-FUNCTIONAL THEORY; SEPARATE TOTAL ENERGIES; INTERACTIONS AB-INITIO; MODEL SYSTEM; ANALOG COMPLEXES; EXCHANGE-ENERGY; REDUCED ERRORS; RECOGNITION; APPROXIMATION
• Štítky: ok, rivok
• Příznaky: Mezinárodní význam

Anotace

In this article we present the first systematic study of the additive properties (i.e. degree of additivity) of the carbohydrate-aromatic moiety CH-pi dispersion interaction. The additive properties were studied on the beta-D-glucopyranose, beta-D-mannopyranose and alpha-L-fucopyranose complexes with the naphthalene molecule by comparing the monodentate (single CH-pi) and bidentate (two CH-pi) complexes. All model complexes were optimized using the DFT-D approach, at the BP/def2-TZVPP level of theory. The interaction energies were refined using single point calculations at highly correlated ab initio methods at the CCSD(T)/CBS level, calculated as E(CBS)(MP2) + (E(CCSD(T)) - E(MP2))(Small) (Basis). Bidentate complexes show very strong interactions in the range from -10.79 up to -7.15 and -8.20 up to -6.14 kcal mol(-1) for the DFT-D and CCSD(T)/CBS level, respectively.

Návaznosti

• ED1.1.00/02.0068, projekt VaV: Název: CEITEC - central european institute of technology
• GD301/09/H004, projekt VaV: Název: Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny

Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny

• LC06030, projekt VaV: Název: Biomolekulární centrum

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum

• MSM0021622413, záměr: Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

• 2SGA2747, interní kód MU: Název: Saccharide - protein dispersion interactions involved in the bacterial recognition processes (Akronym: SaProDI)

Investor: Jihomoravský kraj, Saccharide - protein dispersion interactions involved in the bacterial recognition processes, Granty pro zahraniční vědce

• 205872, interní kód MU: Název: Program developing interdisciplinary research POtential for the STudies of BIOMolecular INteractions (Akronym: POSTBIOMIN)

Investor: Evropská unie, Program developing interdisciplinary research POtential for the STudies of BIOMolecular INteractions, Kapacity