Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins

KULHÁNEK, Petr; Jan ALÁN a Jaroslav KOČA. Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins. In Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic. 2011.

Základní údaje

Originální název

Virtual screening and in silico design of novel inhibitors of bacterial lectins

Autoři

KULHÁNEK, Petr; Jan ALÁN a Jaroslav KOČA

Vydání

Modeling Interactions in Biomolecules V, Kutná Hora, Czech Republic, 2011

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00050027

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

Klíčová slova anglicky

lectins; virtual screening

Štítky

rivok

---

Anotace

V originále

Bacterium Pseudomonas aeruginosa is a human opportunistic pathogen. It can cause infection of immunocompromised people or people suffering from cystic fibrosis, which is often fatal. Bacterial colonization of human tissues is mediated by interaction of bacterial surface proteins – lectins – with cellular surface carbohydrates. PA-IIL is Pseudomonas aeruginosa tetrameric lectin, which contains two calcium ions in each binding site and recognizes fucosylated oligosaccharides1. Saturation of bacterial surface lectins by specially designed compounds might prevent adhesion to host tissues and thus suppress the infection. In this work, virtual screening and docking were used for identification of compounds that might inhibit this interaction and be potentially used as a new generation of antibiotics.

---

Návaznosti

GA303/09/1168, projekt VaV	Název: Lektiny z lidských patogenů - struktura, funkce, inženýrství Investor: Grantová agentura ČR, Lektidy z lidských patogenů - struktura, funkce, inženýrství
GD301/09/H004, projekt VaV	Název: Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanistických studií k chemoterapii rakoviny Investor: Grantová agentura ČR, Molekulární a strukturní biologie vybraných cytostatik. Od mechanických studií k chemoterapii rakoviny
LC06030, projekt VaV	Název: Biomolekulární centrum Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Biomolekulární centrum
ME08008, projekt VaV	Název: Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Návrh antibakteriálních a antivirových léků na bázi cukrů a glykomimetik, Program výzkumu a vývoje KONTAKT (ME)
MSM0021622413, záměr	Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
205872, interní kód MU	Název: Program developing interdisciplinary research POtential for the STudies of BIOMolecular INteractions (Akronym: POSTBIOMIN) Investor: Evropská unie, Program developing interdisciplinary research POtential for the STudies of BIOMolecular INteractions, Kapacity