a 2011

The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase

DEMO, Gabriel; Veronika PAPOUŠKOVÁ; Hana SANDEROVA; Lukáš ŽÍDEK; Michaela WIMMEROVÁ et al.

Základní údaje

Originální název

The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase

Název česky

Roetgenova struktura verzus NMR struktura delta-podjednotky RNA-polymerazy

Vydání

XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu, 2011

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14740/11:00050113

Organizační jednotka

Středoevropský technologický institut

ISBN

978-80-210-5594-0

Klíčová slova česky

X-ray NMR struktura delta-podjednotka porovnani

Klíčová slova anglicky

X-ray NMR structure delta-subunit comparison

Štítky

Změněno: 4. 4. 2012 12:09, Mgr. Nikola Kostlánová, Ph.D.

Anotace

V originále

The N-terminal domain of delta subunit was conquested to high-throughput screening. Iodine compound was used as a co-crystalline substance to have a possibility to provide a Single Anomalous Dispersion (SAD) experiments. Diffraction data were collected at BESSY II Berlin, beamline MX-14.2. The alpha-helical part of the protein is in a good agreement with the NMR structure. In the region of beta-sheets for the NMR structure the X-ray structure showed completely different behaviour (folding).

Česky

N-terminalni domena delta podjednotky byla podrobena siroke krystalizaci na urcei vhodnych krystalizacnich podminek. Jodova sloucenina byla pouzita jako ko-krystalizacni latka kvuli uskutocneni SAD experimentu (anomalni rozptyl). Difrakcni data byli zozbirany na BESSY II v Berlinu na stanovisti MX-14.2. Alfa-helikalni cast proteinu je v souladu s NMR strukturou tohto proteinu. Avsak v oblasti beta-listu ktere byli urceny NMR ukazala roetgenova struktura uplne jine chovani v usporadani.

Návaznosti

GA204/09/0583, projekt VaV
Název: Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií (Akronym: DELTA)
Investor: Grantová agentura ČR, Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím