The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase

DEMO, Gabriel, Veronika PAPOUŠKOVÁ, Hana SANDEROVA, Lukáš ŽÍDEK a Michaela WIMMEROVÁ. The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase. In XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu. 2011. ISBN 978-80-210-5594-0.

Základní údaje

• Originální název: The X-ray structure versus NMR structure of delta-subunit of RNA-polymerase
• Název česky: Roetgenova struktura verzus NMR struktura delta-podjednotky RNA-polymerazy
• Autoři: DEMO, Gabriel (703 Slovensko, domácí), Veronika PAPOUŠKOVÁ (203 Česká republika, domácí), Hana SANDEROVA (203 Česká republika), Lukáš ŽÍDEK (203 Česká republika, domácí) a Michaela WIMMEROVÁ (203 Česká republika, garant, domácí).
• Vydání: XV. Setkani biochemiku a molekularnich biologu, 2011.

Další údaje

• Originální jazyk: angličtina
• Typ výsledku: Konferenční abstrakt
• Obor: 10600 1.6 Biological sciences
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14740/11:00050113
• Organizační jednotka: Středoevropský technologický institut
• ISBN: 978-80-210-5594-0
• Klíčová slova česky: X-ray NMR struktura delta-podjednotka porovnani
• Klíčová slova anglicky: X-ray NMR structure delta-subunit comparison
• Štítky: rivok

Anotace

The N-terminal domain of delta subunit was conquested to high-throughput screening. Iodine compound was used as a co-crystalline substance to have a possibility to provide a Single Anomalous Dispersion (SAD) experiments. Diffraction data were collected at BESSY II Berlin, beamline MX-14.2. The alpha-helical part of the protein is in a good agreement with the NMR structure. In the region of beta-sheets for the NMR structure the X-ray structure showed completely different behaviour (folding).

Anotace česky

N-terminalni domena delta podjednotky byla podrobena siroke krystalizaci na urcei vhodnych krystalizacnich podminek. Jodova sloucenina byla pouzita jako ko-krystalizacni latka kvuli uskutocneni SAD experimentu (anomalni rozptyl). Difrakcni data byli zozbirany na BESSY II v Berlinu na stanovisti MX-14.2. Alfa-helikalni cast proteinu je v souladu s NMR strukturou tohto proteinu. Avsak v oblasti beta-listu ktere byli urceny NMR ukazala roetgenova struktura uplne jine chovani v usporadani.

Návaznosti

• GA204/09/0583, projekt VaV: Název: Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií (Akronym: DELTA)

Investor: Grantová agentura ČR, Delta podjednotka RNA polymerázy z Gram pozitivních bakterií

• MSM0021622413, záměr: Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím

Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím