2011
Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí
FAKTOR, Jakub; Iva STRUHÁROVÁ; Alena FUČÍKOVÁ; Martin HUBÁLEK; Bořivoj VOJTĚŠEK et al.Základní údaje
Originální název
Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí
Název česky
Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí
Název anglicky
Mass-Spectrometry Quantification of Protein Biomarkers by Selected Reaction Monitoring
Autoři
Vydání
Chemické listy, Praha, Česká společnost chemická, 2011, 0009-2770
Další údaje
Jazyk
čeština
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Česká republika
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 0.529
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/11:00050154
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova česky
kvantifikace proteinů; hmotnostní spektrometrie; proteomika
Klíčová slova anglicky
protein quantification; mass spectrometry; proteomics
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 3. 4. 2012 16:33, Ing. Andrea Mikešková
V originále
Monitorování vybraných reakcí (selected reaction monitoring, SRM) je kvantitativní hmotnostně-spektrometrická technika, která se stále více uplatňuje v kvantitativní analýze proteinů na bázi stanovení peptidů. Instrumentace sestává z nanoprůtokové kapalinové chromatografie spojené s ionizací elektrosprejem a hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kavdrupólu. První kvadrupól funguje jako hmotnostní filtr propouštějící vybraný peptid, který je fragmenován ve druhém kvadrupólu pomocí kolizí indukované disociace. Třetí kvadrupól propouští vybrané peptidové fragmenty, které následně dopadají na detektor. Tetnto přístup umož%nuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v jediné analýze s vysokou citlivostí a selektivitou. SRM se proto stává klíčovou metodou tzv. cílené proteomiky. Nejdůležitější aplikace spočívají ve výzkumu živých systémů kde SRM umožňuje rychlé, přesné a cenově přijatelné stanovení proteinů ve velkých počtech vzorků.
Anglicky
Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomics toolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples.
Návaznosti
| GAP304/10/0868, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622413, záměr |
|