VESELÝ, Pavel, Petr BUREŠ, Petr ŠMARDA a Tomáš PAVLÍČEK. Genome size and DNA base composition of geophytes: the mirror of phenology and ecology? Annals of Botany. Oxford: Oxford University Press, roč. 109, č. 1, s. 65-75. ISSN 0305-7364. doi:10.1093/aob/mcr267. 2012.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Genome size and DNA base composition of geophytes: the mirror of phenology and ecology?
Název česky Velikost genomu a obsah GC bazí u geofytů: zrcadlo fenologie a ekologie?
Autoři VESELÝ, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí), Petr BUREŠ (203 Česká republika, domácí), Petr ŠMARDA (203 Česká republika, domácí) a Tomáš PAVLÍČEK (376 Izrael).
Vydání Annals of Botany, Oxford, Oxford University Press, 2012, 0305-7364.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW stránka s abstraktem a pdf článku
Impakt faktor Impact factor: 3.449
Kód RIV RIV/00216224:14310/12:00057232
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Doi http://dx.doi.org/10.1093/aob/mcr267
UT WoS 000298191900006
Klíčová slova česky životní forma; evoluce velikosti genomu; GC obsah; fenologie; délka průduchů; hmotnost semen; ekologie
Klíčová slova anglicky Life-form; geophytes; genome size evolution; GC content; phenology; stomatal length; seed mass; ecology
Štítky AKR
Příznaky Mezinárodní význam, Recenzováno
Změnil Změnil: Mgr. Petr Šmarda, Ph.D., učo 21109. Změněno: 9. 6. 2017 10:47.
Anotace
Background and Aims Genome size is known to affect various plant traits such as stomatal size, seed mass, and flower or shoot phenology. However, these associations are not well understood for species with very large genomes, which are laregly represented by geophytic plants. No detailed associations are known between DNA base composition and genome size or species ecology. Methods Genome sizes and GC contents were measured in 219 geophytes together with tentative morphoanatomical and ecological traits. Key Results Increased genome size was associated with earliness of flowering and tendency to grow in humid conditions, and there was a positive correlation between an increase in stomatal size in species with extremely large genomes. Seed mass of geophytes was closely related to their ecology, but not to genomic parameters. Genomic DNA GC content showed a unimodal relationship with genome size but no relationship with species ecology. Conclusions Evolution of genome size in geophytes is closely related to their ecology and phenology and is also associated with remarkable changes in DNA base composition. Although geophytism together with producing larger cells appears to be an advantageous strategy for fast development of an organism in seasonal habitats, the drought sensitivity of large stomata may restrict the occurrence of geophytes with very large genomes to regions not subject to water stress.
Anotace česky
Velikost ovlivňuje různé vlastnosti rostlinných druhů, jakými je např. velikost průduchů, hmotnost semen či doba květu. Nicméně tyto vztahy nebyly dosud dobře prozkoumány u druhů s velkými genomy, které se často vyskytují u geofytních rostlin. Také vztah mezi genomickým obsahem bází ekologií druhu nebyl dosud zkoumán. V naší studii jsme analyzovali velikost genomu a genomický poměr bází u 219 geofytů ve vztahu k jejich morfologický, anatomickým a ekologickým vlastnostem. Větší velikost genomu se ukázala být spojena s časným počátkem kvetení a tendencí k růstu ve vlhkém prostředí. Úzká pozitivní korelace byla zjištěna právě v případech extrémně velkých genomů. Množství semen geofytů se ukázalo být v těsné vazbě na jejich ekologií, nikoli však na jejich genetické parametry. U genomického obsahu GC bází jsme zjistili unimodální vztah k velikosti genomu, ale žádný vztah k ekologii druhů. Klíčové závěry: Evoluce velikosti genomu u geofytů úzce souvisí s jejich ekologii a fenologií a je také spojena s významnými změnami ve bázovém složení DNA. I když geofytismus spolu s vytvářením větších buněk, se zdá být výhodnou strategií pro rychlý rozvoj organismu na sezónním stanovišti, může být sucho limitujícím faktorem velkých průduchů a tím omezovat výskyt geofytů s velkými genomy na místech s nedostatkem vody.
Návaznosti
GAP506/11/0890, projekt VaVNázev: Evoluce kompozice DNA bazí u vyšších rostlin (Akronym: GCobsah)
Investor: Grantová agentura ČR, Evolution of base composition in land plants
GA206/09/1405, projekt VaVNázev: Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae
GP206/08/P222, projekt VaVNázev: Evoluce GC obsahu a genomu trav
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav
LC06073, projekt VaVNázev: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměrNázev: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 14:25