2012
Genome size and DNA base composition of geophytes: the mirror of phenology and ecology?
VESELÝ, Pavel; Petr BUREŠ; Petr ŠMARDA a Tomáš PAVLÍČEKZákladní údaje
Originální název
Genome size and DNA base composition of geophytes: the mirror of phenology and ecology?
Název česky
Velikost genomu a obsah GC bazí u geofytů: zrcadlo fenologie a ekologie?
Autoři
Vydání
Annals of Botany, Oxford, Oxford University Press, 2012, 0305-7364
Další údaje
Jazyk
angličtina
Typ výsledku
Článek v odborném periodiku
Obor
10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele
Velká Británie a Severní Irsko
Utajení
není předmětem státního či obchodního tajemství
Impakt faktor
Impact factor: 3.449
Označené pro přenos do RIV
Ano
Kód RIV
RIV/00216224:14310/12:00057232
Organizační jednotka
Přírodovědecká fakulta
UT WoS
Klíčová slova česky
životní forma; evoluce velikosti genomu; GC obsah; fenologie; délka průduchů; hmotnost semen; ekologie
Klíčová slova anglicky
Life-form; geophytes; genome size evolution; GC content; phenology; stomatal length; seed mass; ecology
Štítky
Příznaky
Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 9. 6. 2017 10:47, Mgr. Petr Šmarda, Ph.D.
V originále
Background and Aims Genome size is known to affect various plant traits such as stomatal size, seed mass, and flower or shoot phenology. However, these associations are not well understood for species with very large genomes, which are laregly represented by geophytic plants. No detailed associations are known between DNA base composition and genome size or species ecology. Methods Genome sizes and GC contents were measured in 219 geophytes together with tentative morphoanatomical and ecological traits. Key Results Increased genome size was associated with earliness of flowering and tendency to grow in humid conditions, and there was a positive correlation between an increase in stomatal size in species with extremely large genomes. Seed mass of geophytes was closely related to their ecology, but not to genomic parameters. Genomic DNA GC content showed a unimodal relationship with genome size but no relationship with species ecology. Conclusions Evolution of genome size in geophytes is closely related to their ecology and phenology and is also associated with remarkable changes in DNA base composition. Although geophytism together with producing larger cells appears to be an advantageous strategy for fast development of an organism in seasonal habitats, the drought sensitivity of large stomata may restrict the occurrence of geophytes with very large genomes to regions not subject to water stress.
Česky
Velikost ovlivňuje různé vlastnosti rostlinných druhů, jakými je např. velikost průduchů, hmotnost semen či doba květu. Nicméně tyto vztahy nebyly dosud dobře prozkoumány u druhů s velkými genomy, které se často vyskytují u geofytních rostlin. Také vztah mezi genomickým obsahem bází ekologií druhu nebyl dosud zkoumán. V naší studii jsme analyzovali velikost genomu a genomický poměr bází u 219 geofytů ve vztahu k jejich morfologický, anatomickým a ekologickým vlastnostem. Větší velikost genomu se ukázala být spojena s časným počátkem kvetení a tendencí k růstu ve vlhkém prostředí. Úzká pozitivní korelace byla zjištěna právě v případech extrémně velkých genomů. Množství semen geofytů se ukázalo být v těsné vazbě na jejich ekologií, nikoli však na jejich genetické parametry. U genomického obsahu GC bází jsme zjistili unimodální vztah k velikosti genomu, ale žádný vztah k ekologii druhů. Klíčové závěry: Evoluce velikosti genomu u geofytů úzce souvisí s jejich ekologii a fenologií a je také spojena s významnými změnami ve bázovém složení DNA. I když geofytismus spolu s vytvářením větších buněk, se zdá být výhodnou strategií pro rychlý rozvoj organismu na sezónním stanovišti, může být sucho limitujícím faktorem velkých průduchů a tím omezovat výskyt geofytů s velkými genomy na místech s nedostatkem vody.
Návaznosti
| GAP506/11/0890, projekt VaV |
| ||
| GA206/09/1405, projekt VaV |
| ||
| GP206/08/P222, projekt VaV |
| ||
| LC06073, projekt VaV |
| ||
| MSM0021622416, záměr |
|