Způsob diagnostiky invazivní aspergilózy a oligonukleotidy pro použití při tomto způsobu

LENGEROVÁ, Martina, Kristýna HRNČÍŘOVÁ, Zdeněk RÁČIL, Jiří MAYER, Iva KOCMANOVÁ, Šárka POSPÍŠILOVÁ a Dana DVOŘÁKOVÁ. Způsob diagnostiky invazivní aspergilózy a oligonukleotidy pro použití při tomto způsobu. 2011. Patent. Číslo: 302670. Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví. Místo vydání: Praha. Název vlastníka: Masarykova univerzita Brno. Datum registrace: 21. 4. 2009. Datum přijetí: 13. 7. 2011.

Základní údaje

• Originální název: Způsob diagnostiky invazivní aspergilózy a oligonukleotidy pro použití při tomto způsobu
• Název česky: Způsob diagnostiky invazivní aspergilózy a oligonukleotidy pro použití při tomto způsobu
• Název anglicky: Method of diagnosis of invasive aspergillosis and oligonucleotides for use in this way
• Autoři: LENGEROVÁ, Martina (203 Česká republika, garant, domácí), Kristýna HRNČÍŘOVÁ (203 Česká republika, domácí), Zdeněk RÁČIL (203 Česká republika, domácí), Jiří MAYER (203 Česká republika, domácí), Iva KOCMANOVÁ (203 Česká republika, domácí), Šárka POSPÍŠILOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Dana DVOŘÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí).
• Vydání: Číslo: 302670, Vydavatel: Úřad průmyslového vlastnictví, Místo vydání: Praha, Název vlastníka: Masarykova univerzita Brno, 2011.

Další údaje

• Originální jazyk: čeština
• Typ výsledku: Patent
• Obor: 30200 3.2 Clinical medicine
• Stát vydavatele: Česká republika
• Utajení: není předmětem státního či obchodního tajemství
• Kód RIV: RIV/00216224:14110/11:00067358
• Organizační jednotka: Lékařská fakulta
• Klíčová slova anglicky: invasive aspergillosis; Aspergillus fumigatus ribosomal DNA
• Štítky: rivok

Anotace

Způsob diagnostiky invazivní aspergilózy pomocí izolace a detekce DNA Aspergillus fumigatus v biologických vzorcích odebraných z těla pacienta spočívající v tom, že se z biologického vzorku izoluje DNA a poté se provede detekce množství genu ITS2 (internal transcribed spacer 2) pro ribozomální DNA Aspergillus fumigatus metodou kvantitativní PCR, přičemž se jako primery pro kvantitativní PCR použijí oligonukleotidy mající alespoň 85% identitu nukleotidové sekvence se sekvencemi GGCTTTGTCACCTGCTCTGTAG (SEQ ID NO. 2) a CTGATCCGAGGTCAACCTTAGAAA (SEQ ID NO. 3), a jako sonda se použije TaqMan MGB sonda, která má alespoň 85% identitu nukleotidové sekvence se sekvencí CCGACACCCAACTTT - MGB (SEQ ID NO. 4), přičemž snížení identity až na 85 % je dosaženo prodloužením nebo zkrácením primerů a/nebo sondy. Předmětem řešení jsou i nové oligonukleotidy pro použití v diagnostice invazivní aspergilózy.

Anotace anglicky

Method of diagnosis of invasive aspergillosis using DNA isolation and detection of Aspergillus fumigatus in biological samples taken from the patient resting in the fact that from a biological sample isolated DNA and then performs detection of gene ITS2 (internal transcribed spacer 2) for Aspergillus fumigatus ribosomal DNA by quantitative PCR with primers as for quantitative PCR used oligonucleotides having at least 85% nucleotide sequence identity with sequences GGCTTTGTCACCTGCTCTGTAG (SEQ ID NO. 2) and CTGATCCGAGGTCAACCTTAGAAA (SEQ ID NO. 3), and is used as a probe TaqMan MGB probe, which has at least 85% nucleotide sequence identity with a sequence CCGACACCCAACTTT - MGB (SEQ ID NO. 4), the reduction of identity to 85% is achieved by extending or shortening the primers and / or probe. The subject of how the new oligonucleotides for use in the diagnosis of invasive aspergillosis.