J 2012

Kinetics of anaerobic elemental sulfur oxidation by ferric iron in Acidithiobacillus ferrooxidans and protein identification by comparative 2-DE-MS/MS

KUČERA, Jiří; Pavel BOUCHAL; Hana ČERNÁ; David POTĚŠIL; Oldřich JANICZEK et al.

Základní údaje

Originální název

Kinetics of anaerobic elemental sulfur oxidation by ferric iron in Acidithiobacillus ferrooxidans and protein identification by comparative 2-DE-MS/MS

Název česky

Kinetika anaerobní oxidace síry železitými ionty u bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans a identifikace proteinů pomocí 2-DE-MS/MS

Vydání

ANTONIE VAN LEEUWENHOEK INTERNATIONAL JOURNAL OF GENERAL AND MOLECULAR MICROBIOLOGY, DORDRECHT (NETHERLANDS), Springer, 2012, 0003-6072

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Článek v odborném periodiku

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Nizozemské království

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Impakt faktor

Impact factor: 2.072

Označené pro přenos do RIV

Ano

Kód RIV

RIV/00216224:14310/12:00057288

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

Klíčová slova česky

Acidithiobacillus; Anaerobní oxidace síry, Redukce Fe(III), Proteomika; MS analýza

Klíčová slova anglicky

Acidithiobacillus; Anaerobic sulfur oxidation; Ferric iron reduction; Proteomics; MS analysis

Štítky

Příznaky

Mezinárodní význam, Recenzováno
Změněno: 13. 1. 2016 09:57, doc. Ing. Martin Mandl, CSc.

Anotace

V originále

Elemental sulfur oxidation by ferric iron in Acidithiobacillus ferrooxidans was investigated. The apparent Michaelis constant for ferric iron was 18.6 mM. An absence of anaerobic ferric iron reduction ability was observed in bacteria maintained on elemental sulfur for an extended period of time. Upon transition from ferrous iron to elemental sulfur medium, the cells exhibited similar kinetic characteristics of ferric iron reduction under anaerobic conditions to those of cells that were originally maintained on ferrous iron. Nevertheless, a total loss of anaerobic ferric iron reduction ability after the sixth passage in elemental sulfur medium was demonstrated. The first proteomic screening of total cell lysates of anaerobically incubated bacteria resulted in the detection of 1599 protein spots in the master two-dimensional electrophoresis gel. A set of 59 more abundant and 49 less abundant protein spots that changed their protein abundances in an anaerobiosis-dependent manner was identified and compared to iron- and sulfur-grown cells, respectively. Proteomic analysis detected a significant increase in abundance under anoxic conditions of electron transporters, such as rusticyanin and cytochrome c552, involved in the ferrous iron oxidation pathway. Therefore we suggest the incorporation of rus-operon encoded proteins in the anaerobic respiration pathway. Two sulfur metabolism proteins were identified, pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase and sulfide-quinone reductase. The important transcription regulator, ferric uptake regulation protein, was anaerobically more abundant. The anaerobic expression of several proteins involved in cell envelope formation indicated a gradual adaptation to elemental sulfur oxidation.

Česky

Byla studována kinetika a proteomika anaerobní oxidace síry ionty Fe(III) u Acidithiobacillus ferrooxidans. Zdánlivá Michaelisova konstanta pro Fe(III) byla 18,6 mM. Bakterie udržované na síře ztrácely schopnost anaerobní oxidace síry. První proteomická analýza buněčného lýzátu vyústila v 1599 proteinových spotů za použití srovnávací 2-DE. Proteinové složení bylo konfrontováno s bakteriemi oxidujícími železo(II) a síru a vyhodnoceny typické proteiny odpovídající anaerobióze. Výsledky poukazují na hlavní metabolické dráhy daného procesu.

Návaznosti

GA525/08/0697, projekt VaV
Název: Aktivita acidofilních bakterií oxidujících síru za aerobních a anaerobních podmínek
Investor: Grantová agentura ČR, Aktivita acidofilních bakterií oxidujících síru za aerobních a anaerobních podmínek
MSM0021622413, záměr
Název: Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
MSM0021622415, záměr
Název: Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací

Přiložené soubory

ZVV_2012_07_974964.pdf
Požádat o autorskou verzi souboru