a 2011

Genome Size and DNA Base Composition of Geophytes: the Mirror of Phenology and Ecology?

VESELÝ, Pavel

Základní údaje

Originální název

Genome Size and DNA Base Composition of Geophytes: the Mirror of Phenology and Ecology?

Název česky

Velikost genomu a DNA kompozice bazí u geofytů: zrcadlo fenologie a ekologie?

Autoři

VESELÝ, Pavel (203 Česká republika, garant, domácí)

Vydání

Analytická cytometrie 2011, 2011

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Konferenční abstrakt

Obor

10600 1.6 Biological sciences

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Kód RIV

RIV/00216224:14310/11:00050576

Organizační jednotka

Přírodovědecká fakulta

ISBN

978-80-260-0676-3

UT WoS

000298191900006

Klíčová slova česky

geofyty; průduchy; evoluce velikosti genomu; genomický GC obsah; fenologie; ekologie

Klíčová slova anglicky

geophytes; stomata; genome size evolution; genomic GC content; phenology; ecology

Příznaky

Mezinárodní význam
Změněno: 15. 3. 2012 15:33, Mgr. Petr Šmarda, Ph.D.

Anotace

V originále

Genome size is known to affect various plant traits such as stomatal size, seed mass, and flower or shoot phenology. However, these associations are still not well understood for the species with giant genomes, mostly represented by geophytic plants. No detailed associations are known between DNA base composition and genome size or species ecology. Genome sizes and GC contents were measured using flow-cytometry in a worldwide sample of geophytes together tentative morpho-anatomical and ecological traits. Data were analyzed using conventional statistics and using analysis of phylogenetically independent contrasts. Increase in genome size was associated with earliness of flowering, tendency to grow in humid conditions, and tightly positively correlated with increase in stomatal size, namely in extremely large genomes. Seed mass of geophytes was closely related to their ecology, but not to genomic parameters. Genomic GC content showed unimodal relationship with genome size but no relation with species ecology. Evolution of genome size in geophytes is closely related with their ecology and phenology and also associates with remarkable changes in DNA base composition. While geophytism together with producing larger cells seems advantageous strategy for fast development of an organism in seasonal habitats, this is perhaps the drought sensitivity of large stomata which restrict the occurrence of geophytes with giant genomes to water non-stressed conditions.

Návaznosti

GAP506/11/0890, projekt VaV
Název: Evoluce kompozice DNA bazí u vyšších rostlin (Akronym: GCobsah)
Investor: Grantová agentura ČR, Evolution of base composition in land plants
GP206/08/P222, projekt VaV
Název: Evoluce GC obsahu a genomu trav
Investor: Grantová agentura ČR, Evoluce GC obsahu a genomu trav
LC06073, projekt VaV
Název: Centrum pro výzkum biodiverzity
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Centrum pro výzkum biodiverzity
MSM0021622416, záměr
Název: Diverzita biotických společenstev a populací: kauzální analýza variability v prostoru a čase
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase