TESAŘOVÁ, Lenka, Irena KRONTORÁD KOUTNÁ, Magdaléna DVOŘÁKOVÁ a Martin KLABUSAY. Relative expression of gammadelta T-cell receptor gene families detected by RT–PCR and capillary electrophoresis. International Journal of immunogenetics. Blackwell Publishing Ltd, roč. 39, č. 5, s. 381-388. ISSN 1744-3121. doi:10.1111/j.1744-313X.2012.01114.x. 2012.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Relative expression of gammadelta T-cell receptor gene families detected by RT–PCR and capillary electrophoresis
Název česky relativní exprese gamadelta TCR genových rodin detekována pomocí RT-PCR a kapilární elektroforézy
Autoři TESAŘOVÁ, Lenka (203 Česká republika, domácí), Irena KRONTORÁD KOUTNÁ (203 Česká republika, garant, domácí), Magdaléna DVOŘÁKOVÁ (203 Česká republika, domácí) a Martin KLABUSAY (203 Česká republika).
Vydání International Journal of immunogenetics, Blackwell Publishing Ltd, 2012, 1744-3121.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Článek v odborném periodiku
Obor 10601 Cell biology
Stát vydavatele Velká Británie a Severní Irsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
WWW URL
Impakt faktor Impact factor: 1.355
Kód RIV RIV/00216224:14330/12:00059919
Organizační jednotka Fakulta informatiky
Doi http://dx.doi.org/10.1111/j.1744-313X.2012.01114.x
UT WoS 000308406600002
Klíčová slova česky Zpětná PCR; Kapilární elektroforéza; gamadelta T lymfocyty; TCR; Vgama a Vdelta genové rodiny
Klíčová slova anglicky Reverse transcription PCR; Capillary electrophoresis; gammadelta T cell; TCR; Vgamma and Vdelta gene families
Štítky cbia-web
Změnil Změnila: Mgr. Lenka Tesařová, Ph.D., učo 78340. Změněno: 2. 3. 2018 10:13.
Anotace
Gammadelta T cells are intensively studied because their function in infection, allergy, autoimmune disease, cancer and post-transplant period is not yet fully understood. PCR-based techniques were established to study the gamma variable (Vgamma) and delta variable (Vdelta) gene families. PCR product evaluation is routinely carried out by Southern blot analysis or the third complementarity-determining region (CDR3) spectratyping, but a fast and simple assessment of Vgamma and Vdelta gene family expression is missing. The aim of our study was to test capillary electrophoresis as a potential method for evaluating the composition of the gammadelta T-cell population. This report provides optimized PCR conditions for gammadelta T-cell receptor amplification. Further it describes the utilization of capillary electrophoresis in the Agilent 2100 Bioanalyzer to evaluate the relative expression of Vgamma and Vdelta gene families after their amplification. An application of the methodology to peripheral blood mononuclear cell samples from patients during hemato-oncological treatment is shown. The described methodology is fast and simple to operate and is therefore suitable as a first screening of the gammadelta T-cell population composition in tissues of interest.
Anotace česky
Gamadelta T lymfocyty jsou předmětem intenzivního výzkumu, protože jejich funkce během infekcí, alergií, autoimunitních chorob, nádorů a po transplantacích není stále plně objasněna. Ke studiu Vgama a Vdelta genových rodin byly zavedeny techniky založené na PCR. Produkty PCR jsou běžně hodnoceny pomocí Southernova blotingu či CDR3 spektratypizace, ale rychlé a jednoduché zhodnocení exprese Vgama a Vdelta genových rodin chybí. Cílem naší studie bylo zhodnotit kapilární elektroforézu jako možný nástroj na zhodnocení populace gamadelta T lymfocytů. Tato práce poskytuje optimalizované podmínky PCR na amplifikaci gamadelta TCR. Dále popisuje využití kapilární elektroforézy na přístroji Agilent 2100 Bioanalyzer pro stanovení relativní exprese Vgama a Vdelta genových rodin po jejich amplifikaci. Tato metodika je aplikována na vzorky mononukleárních buněk periferní krve od pacientů při hemato-onkologické léčbě. Uvedená metodika je rychlá a snadná na provedení, a proto je vhodná na první vyšetření složení populace gamadelta T lymfocytů v cílové tkáni.
Návaznosti
MSM0021622430, záměrNázev: Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie
NS9681, projekt VaVNázev: Studium molekulárně-biologické odpovědi na intenzivní inzulínovou terapii při plicních resekcích
Investor: Ministerstvo zdravotnictví ČR, Studium molekulárně-biologické odpovědi na intenzivní inzulínovou terapii při plicních resekcích
VytisknoutZobrazeno: 19. 4. 2024 11:48