KREPL, Miroslav, Kamila RÉBLOVÁ a Jiří ŠPONER. Molecular dynamics of ribosomal L1 stalk. In Dynamics of Protein-Nucleic Acid Interactions: Integrating Simulations with Experiments. 2011.
Další formáty:   BibTeX LaTeX RIS
Základní údaje
Originální název Molecular dynamics of ribosomal L1 stalk
Název česky Molekulová dynamika ribosomálního L1 stalku
Autoři KREPL, Miroslav, Kamila RÉBLOVÁ a Jiří ŠPONER.
Vydání Dynamics of Protein-Nucleic Acid Interactions: Integrating Simulations with Experiments, 2011.
Další údaje
Originální jazyk angličtina
Typ výsledku Konferenční abstrakt
Obor 10600 1.6 Biological sciences
Stát vydavatele Švýcarsko
Utajení není předmětem státního či obchodního tajemství
Organizační jednotka Přírodovědecká fakulta
Klíčová slova anglicky L1 stalk
Změnil Změnil: RNDr. Miroslav Krepl, Ph.D., učo 324182. Změněno: 22. 5. 2012 22:07.
Anotace
The ribosomal L1 stalk is assumed to play important role in releasing deacylated tRNA from ribosome. During elongation cycle, L1 stalk moves between three distinct positions in relation to large subunit, crossing a distance of up to 60 Å. We performed molecular dynamics simulations of L1 stalk taken from structure of Thermus thermophilus ribosome. The simulations revealed significant structural changes in L1 stalk/tRNA boundary, which might be important in facilitation of tRNA release. We also observed coupling between L1 RNA and L1 protein movement in relation to tRNA, which suggests critical role of protein-nucleic acid interactions for L1 stalk function.
VytisknoutZobrazeno: 2. 7. 2024 11:34