Výpis publikací

NYKRÝNOVÁ, Markéta; Matěj BEZDÍČEK; Kristýna DUFKOVÁ; Martina LENGEROVÁ a Helena SKUTKOVÁ. Hybrid mapping for plasmid content determination in NGS data. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko. 2023.

BEZDÍČEK, Matěj; Jana HANSLIKOVÁ; Markéta NYKRÝNOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. New Enterococcus faecium multilocus sequence typing scheme based on whole-genome sequencing data. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko. 2023.

BEZDÍČEK, Matěj; Jana HANSLIKOVA; Marketa NYKRYNOVA; Kristýna DUFKOVÁ; Iva KOCMANOVA; Petra KUBACKOVA; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. New Multilocus Sequence Typing Scheme for Enterococcus faecium Based on Whole Genome Sequencing Data. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: AMER SOC MICROBIOLOGY, 2023, roč. 11, č. 4, s. 1-9. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/spectrum.05107-22.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Markéta NYKRÝNOVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Petra KUBÁČKOVÁ; Jana HANSLIKOVA; Karolina FEJKOVA; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Rapid Identification of Pseudomonas aeruginosa International High-Risk Clones Based on High-Resolution Melting Analysis. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: AMER SOC MICROBIOLOGY, 2023, roč. 11, č. 1, s. 1-9. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/spectrum.03571-22.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Jana HANSLIKOVÁ; Markéta NYKRÝNOVÁ; Petra KUBÁČKOVÁ; Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. The indication of possible K1/K2 serotypes of Klebsiella pneumoniae using mini-MLST. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko. 2023.

BEZDÍČEK KRÁLOVÁ, Stanislava; Mathias FLIEDER; Songcan CHEN; Peter SPACEK; Matěj BEZDÍČEK; Kristýna DUFKOVÁ; Martin ZEHL; Sergey ZOTCHEV; Thomas RATTEI a Alexander LOY. Untapped biosynthetic potential of Antarctic soil bacteria. In 10th FEMS Congress of European Microbiologists (FEMS 2023). 2023.

BEZDÍČEK, Matěj; Kristýna DUFKOVÁ; Markéta NYKRÝNOVÁ; Jana HANSLIKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií. Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi. Trios s.r.o., 2022, roč. 28, č. 4, s. 106-115. ISSN 1211-264X.

BEZDÍČEK, Matěj; Markéta NYKRÝNOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Molecular epidemiology using local population specific references – is it worth the effort? In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon. 2022.

BEZDÍČEK, Matěj; Markéta NYKRÝNOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; Jana HANSLIKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Nové MLST schéma pro Enterococcus faecium vycházející z dat získaných celogenomovým sekvenováním. In 29. kongres československé společnosti mikrobiologické, Brno. 2022.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Markéta NYKRÝNOVÁ; Petra KUBÁČKOVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Ivana VÍTKOVÁ; Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ a Martina LENGEROVÁ. Pseudomonas aeruginosa molecular typing: introduction of novel HRM-based approach. In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon. 2022.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Kristýna DUFKOVÁ; Ivo CHAMRÁD; René LENOBEL; Darina ČEJKOVÁ; Marcel KOSINA; Matěj HRALA; Veronika HOLÁ; Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. Pyocin-mediated antagonistic interactions in Pseudomonas spp. isolated in James Ross Island, Antarctica. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2022, roč. 24, č. 3, s. 1294-1307. ISSN 1462-2912. Dostupné z: https://doi.org/10.1111/1462-2920.15809.

NYKRÝNOVÁ, Markéta; Roman JAKUBÍČEK; Matěj BEZDÍČEK; Kristýna DUFKOVÁ; Martina LENGEROVÁ a Helena SKUTKOVÁ. Real-time MLST genes detection in nanopore squiggles. In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon. 2022.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Markéta NYKRÝNOVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Ivana VÍTKOVÁ; Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Rychlá molekulární typizace Pseudomonas aeruginosa pro účely nemocniční epidemiologie. In VIII. Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie, Praha. 2022.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Kristina CUPROVA; Dagmar PANTUCKOVA; Marketa NYKRYNOVA; Eva BRHELOVA; Iva KOCMANOVA; Silvie HODOVA; Marketa HANSLIANOVA; Tomas JUREN; Břetislav LIPOVÝ; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Sequencing Independent Molecular Typing of Staphylococcus aureus Isolates: Approach for Infection Control and Clonal Characterization. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: American Society for Microbiology, 2022, roč. 10, č. 1, s. 1-10. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://doi.org/10.1128/spectrum.01817-21.

MANOVÁ, Anna; Blanka HÝŽOVÁ; Diana Darriba CANORA; Ana Castrillo ANTOLIN a Kristýna DUFKOVÁ. Vitality and growth rate of agar plate-cultivated Antarctic microautotrophs: Analysis of PSII functioning by chlorophyll fluorescence parameters. Czech polar reports. Brno: Masaryk University, 2022, roč. 12, č. 2, s. 269-279. ISSN 1805-0689. Dostupné z: https://doi.org/10.5817/CPR2022-2-20.

NYKRÝNOVÁ, Markéta; Matěj BEZDÍČEK; Martina STRNADOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; M LENGEROVÁ a H. SKUTKOVÁ. Bacterial typing via raw nanopore signals. In 31st European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2021.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Iva KOCMANOVÁ; Martina STRNADOVÁ; Ivana VÍTKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Development of sequencing independent approach for Pseudomonas aeruginosa typing. In Federation of Infection Societies Conference. 2021.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Kristina PLEVOVÁ; Dagmar PANTŮČKOVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Molekulární a epidemiologická charakteristika Staphylococcus aureus dominujících v nemocničním prostředí pomocí HRM analýzy. In XXVII. Moravsko-slovenské mikrobiologické dny. 2021.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Kristýna DUFKOVÁ a David ŠMAJS. Pseudomonas prosekii isolated in Antarctica inhibits plantpathogenic strains of Pseudomonas viridiflava and Pseudomonas fluorescens. Czech Polar Reports. Brno: Masaryk University, Department of Experimental Biology, 2021, roč. 11, č. 2, s. 270-278. ISSN 1805-0689. Dostupné z: https://doi.org/10.5817/CPR2021-2-18.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Kristýna DUFKOVÁ; Petra KLIMEŠOVÁ a Veronika HOLÁ. Pyocin production by urinary catheter-related Pseudomonas aeruginosa. In 30. Tomáškovy dny. 2021. ISBN 978-80-210-9882-4.

DUFKOVÁ, Kristýna; Matěj BEZDÍČEK; Martina STRNADOVÁ; Markéta NYKRÝNOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Sequencing-independent approach for characterisation of Staphylococcus aureus population structure. In 31st ECCMID. 2021.

BEZDÍČEK, Matěj; Kristýna DUFKOVÁ; Markéta NYKRÝNOVÁ; Iva KOCMANOVÁ; Ivana VÍTKOVÁ; Tomáš KABUT; Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Současné možnosti molekulární typizace bakterií způsobujících infekce spojené se zdravotnickou péčí a jejich využití v klinické praxi. In XXVII. Moravsko-slovenské mikrobiologické dny. 2021.

JÍLKOVÁ, Veronika; Kristýna DUFKOVÁ a Tomáš CAJTHAML. Decomposition of labile and recalcitrant coniferous litter fractions affected by temperature during the growing season. Journal of Forestry Research. Harbin: Northeast Forestry University, 2020, roč. 31, č. 4, s. 1115-1121. ISSN 1007-662X. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s11676-018-00877-7.

BEZDÍČEK, Matěj; Markéta NYKRÝNOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; Kristina PLEVOVÁ; Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Epidemiology typing and molecular analysis of vancomycin-resistant Enterococcus foeclum in haemato-oncological patients. In 30th ECCMID 2020. 2020.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Darina ČEJKOVÁ; Kristýna DUFKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions. Archives of Microbiology. New York: Springer, 2020, roč. 202, č. 3, s. 447-454. ISSN 0302-8933. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s00203-019-01755-4.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Kristýna DUFKOVÁ; Petra KLIMEŠOVÁ; Martina VANĚRKOVÁ; Filip RŮŽIČKA a Veronika HOLÁ. Prevalence of bacteriocins and their co-association with virulence factors within Pseudomonas aeruginosa catheter isolates. International Journal of Medical Microbiology. Munich: Elsevier, 2020, roč. 310, č. 8, s. 1-7. ISSN 1438-4221. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.ijmm.2020.151454.

BARTÁK, Miloš; Peter VÁCZI; Josef HÁJEK; Alla OREKHOVA; Michaela BEDNAŘÍKOVÁ; Kateřina TRNKOVÁ a Kristýna DUFKOVÁ. Výzkum fyziologických procesů autotrofů z polárních oblastí Země ve vztahu k teplotě: Terénní a laboratorní studie využívající biofyzikální metody měření. In In: Sborník abstraktů. 2. konference Sekce pro biologii nízkých teplot Česko-slovenské biologické společnosti, z. s.,,Metodologie studia živých organismů při teplotách pod bodem mrazu“ a workshop ,,Kryokonzervace tkání a buněk“, 14.-15.9.2020, Hradec Králové. 2020.

SNOPKOVÁ, Kateřina; Kristýna DUFKOVÁ; Darina ČEJKOVÁ; Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. The genome sequence of Pseudomonas prosekii, a novel Antarctic bacterium. In Proceedings: Students in Polar and Alpine Research Conference 2018. 2018. ISBN 978-80-210-8957-0.