Výpis publikací

NYKRÝNOVÁ, Markéta, Matěj BEZDÍČEK, Kristýna DUFKOVÁ, Martina LENGEROVÁ a Helena SKUTKOVÁ. Hybrid mapping for plasmid content determination in NGS data. Online. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko

BEZDÍČEK, Matěj, Jana HANSLIKOVÁ, Markéta NYKRÝNOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. New Enterococcus faecium multilocus sequence typing scheme based on whole-genome sequencing data. Online. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko

BEZDÍČEK, Matěj, Jana HANSLIKOVA, Marketa NYKRYNOVA, Kristýna DUFKOVÁ, Iva KOCMANOVA, Petra KUBACKOVA, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. New Multilocus Sequence Typing Scheme for Enterococcus faecium Based on Whole Genome Sequencing Data. Online. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: AMER SOC MICROBIOLOGY, roč. 11, č. 4, s. 1-9. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.05107-22

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Markéta NYKRÝNOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Petra KUBÁČKOVÁ, Jana HANSLIKOVA, Karolina FEJKOVA, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Rapid Identification of Pseudomonas aeruginosa International High-Risk Clones Based on High-Resolution Melting Analysis. Online. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: AMER SOC MICROBIOLOGY, roč. 11, č. 1, s. 1-9. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.03571-22

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Jana HANSLIKOVÁ, Markéta NYKRÝNOVÁ, Petra KUBÁČKOVÁ, Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. The indication of possible K1/K2 serotypes of Klebsiella pneumoniae using mini-MLST. Online. In ECCMID 2023: 33rd European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases, Dánsko

BEZDÍČEK KRÁLOVÁ, Stanislava, Mathias FLIEDER, Songcan CHEN, Peter SPACEK, Matěj BEZDÍČEK, Kristýna DUFKOVÁ, Martin ZEHL, Sergey ZOTCHEV, Thomas RATTEI a Alexander LOY. Untapped biosynthetic potential of Antarctic soil bacteria. Online. In 10th FEMS Congress of European Microbiologists (FEMS 2023)

BEZDÍČEK, Matěj, Kristýna DUFKOVÁ, Markéta NYKRÝNOVÁ, Jana HANSLIKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Metody sekvenování druhé a třetí generace a jejich praktické využití pro typizaci bakterií. Online. Klinicka Mikrobiologie a Infekcni Lekarstvi. Trios s.r.o., roč. 28, č. 4, s. 106-115. ISSN 1211-264X

BEZDÍČEK, Matěj, Markéta NYKRÝNOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Molecular epidemiology using local population specific references – is it worth the effort?. Online. In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon

BEZDÍČEK, Matěj, Markéta NYKRÝNOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Jana HANSLIKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Nové MLST schéma pro Enterococcus faecium vycházející z dat získaných celogenomovým sekvenováním. Online. In 29. kongres československé společnosti mikrobiologické, Brno

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Markéta NYKRÝNOVÁ, Petra KUBÁČKOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Ivana VÍTKOVÁ, Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ a Martina LENGEROVÁ. Pseudomonas aeruginosa molecular typing: introduction of novel HRM-based approach. Online. In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon

SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ, Ivo CHAMRÁD, René LENOBEL, Darina ČEJKOVÁ, Marcel KOSINA, Matěj HRALA, Veronika HOLÁ, Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. Pyocin-mediated antagonistic interactions in Pseudomonas spp. isolated in James Ross Island, Antarctica. Online. ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY. HOBOKEN: WILEY, roč. 24, č. 3, s. 1294-1307. ISSN 1462-2912. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15809

NYKRÝNOVÁ, Markéta, Roman JAKUBÍČEK, Matěj BEZDÍČEK, Kristýna DUFKOVÁ, Martina LENGEROVÁ a Helena SKUTKOVÁ. Real-time MLST genes detection in nanopore squiggles. Online. In 32th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID) 2022, Portugalsko, Lisabon

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Markéta NYKRÝNOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Ivana VÍTKOVÁ, Lenka ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Rychlá molekulární typizace Pseudomonas aeruginosa pro účely nemocniční epidemiologie. Online. In VIII. Kongres klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie, Praha

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Kristina CUPROVA, Dagmar PANTUCKOVA, Marketa NYKRYNOVA, Eva BRHELOVA, Iva KOCMANOVA, Silvie HODOVA, Marketa HANSLIANOVA, Tomas JUREN, Břetislav LIPOVÝ, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Sequencing Independent Molecular Typing of Staphylococcus aureus Isolates: Approach for Infection Control and Clonal Characterization. Online. Microbiology Spectrum. WASHINGTON: American Society for Microbiology, roč. 10, č. 1, s. 1-10. ISSN 2165-0497. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1128/spectrum.01817-21

MANOVÁ, Anna, Blanka HÝŽOVÁ, Diana Darriba CANORA, Ana Castrillo ANTOLIN a Kristýna DUFKOVÁ. Vitality and growth rate of agar plate-cultivated Antarctic microautotrophs: Analysis of PSII functioning by chlorophyll fluorescence parameters. Online. Czech polar reports. Brno: Masaryk University, roč. 12, č. 2, s. 269-279. ISSN 1805-0689. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CPR2022-2-20

NYKRÝNOVÁ, Markéta, Matěj BEZDÍČEK, Martina STRNADOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, M LENGEROVÁ a H. SKUTKOVÁ. Bacterial typing via raw nanopore signals. Online. In 31st European Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Iva KOCMANOVÁ, Martina STRNADOVÁ, Ivana VÍTKOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Development of sequencing independent approach for Pseudomonas aeruginosa typing. Online. In Federation of Infection Societies Conference

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Kristina PLEVOVÁ, Dagmar PANTŮČKOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Molekulární a epidemiologická charakteristika Staphylococcus aureus dominujících v nemocničním prostředí pomocí HRM analýzy. Online. In XXVII. Moravsko-slovenské mikrobiologické dny

SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ a David ŠMAJS. Pseudomonas prosekii isolated in Antarctica inhibits plantpathogenic strains of Pseudomonas viridiflava and Pseudomonas fluorescens. Online. Czech Polar Reports. Brno: Masaryk University, Department of Experimental Biology, roč. 11, č. 2, s. 270-278. ISSN 1805-0689. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.5817/CPR2021-2-18

SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ, Petra KLIMEŠOVÁ a Veronika HOLÁ. Pyocin production by urinary catheter-related Pseudomonas aeruginosa. Online. In 30. Tomáškovy dny. ISBN 978-80-210-9882-4

DUFKOVÁ, Kristýna, Matěj BEZDÍČEK, Martina STRNADOVÁ, Markéta NYKRÝNOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Sequencing-independent approach for characterisation of Staphylococcus aureus population structure. Online. In 31st ECCMID

BEZDÍČEK, Matěj, Kristýna DUFKOVÁ, Markéta NYKRÝNOVÁ, Iva KOCMANOVÁ, Ivana VÍTKOVÁ, Tomáš KABUT, Jiří MAYER a Martina LENGEROVÁ. Současné možnosti molekulární typizace bakterií způsobujících infekce spojené se zdravotnickou péčí a jejich využití v klinické praxi. Online. In XXVII. Moravsko-slovenské mikrobiologické dny

JÍLKOVÁ, Veronika, Kristýna DUFKOVÁ a Tomáš CAJTHAML. Decomposition of labile and recalcitrant coniferous litter fractions affected by temperature during the growing season. Online. Journal of Forestry Research. Harbin: Northeast Forestry University, roč. 31, č. 4, s. 1115-1121. ISSN 1007-662X. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s11676-018-00877-7

BEZDÍČEK, Matěj, Markéta NYKRÝNOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Kristina PLEVOVÁ, Iva KOCMANOVÁ a Martina LENGEROVÁ. Epidemiology typing and molecular analysis of vancomycin-resistant Enterococcus foeclum in haemato-oncological patients. Online. In 30th ECCMID 2020

SNOPKOVÁ, Kateřina, Darina ČEJKOVÁ, Kristýna DUFKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. Genome sequences of two Antarctic strains of Pseudomonas prosekii: insights into adaptation to extreme conditions. Online. Archives of Microbiology. New York: Springer, roč. 202, č. 3, s. 447-454. ISSN 0302-8933. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1007/s00203-019-01755-4

SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ, Petra KLIMEŠOVÁ, Martina VANĚRKOVÁ, Filip RŮŽIČKA a Veronika HOLÁ. Prevalence of bacteriocins and their co-association with virulence factors within Pseudomonas aeruginosa catheter isolates. Online. International Journal of Medical Microbiology. Munich: Elsevier, roč. 310, č. 8, s. 1-7. ISSN 1438-4221. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.ijmm.2020.151454

BARTÁK, Miloš, Peter VÁCZI, Josef HÁJEK, Alla OREKHOVA, Michaela BEDNAŘÍKOVÁ, Kateřina TRNKOVÁ a Kristýna DUFKOVÁ. Výzkum fyziologických procesů autotrofů z polárních oblastí Země ve vztahu k teplotě: Terénní a laboratorní studie využívající biofyzikální metody měření. Online. In In: Sborník abstraktů. 2. konference Sekce pro biologii nízkých teplot Česko-slovenské biologické společnosti, z. s.,,Metodologie studia živých organismů při teplotách pod bodem mrazu“ a workshop ,,Kryokonzervace tkání a buněk“, 14.-15.9.2020, Hradec Králové

SNOPKOVÁ, Kateřina, Kristýna DUFKOVÁ, Darina ČEJKOVÁ, Ivo SEDLÁČEK a David ŠMAJS. The genome sequence of Pseudomonas prosekii, a novel Antarctic bacterium. Online. In Proceedings: Students in Polar and Alpine Research Conference 2018. ISBN 978-80-210-8957-0