Výpis publikací

BOUDNÁ, Marie; Nicolas BLAVET; Tetiana SAMOILENKO; Táňa MACHÁČKOVÁ; Robin JUGAS; Petra VYCHYTILOVÁ; Miroslav BOUDNÝ; Renata BARTOŠOVÁ; Jan KOTOUCEK; Vojtěch BYSTRÝ; Kateřina KOŽELKOVÁ; Ondřej SLABÝ a Kamila SOUČKOVÁ. Analysis of extracellular vesicles of frequently used colorectal cancer cell lines. BMC Cancer. London: BMC, 2025, roč. 25, č. 1, s. 1-17. ISSN 1471-2407. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12885-025-13936-0.

VYCHYTILOVÁ, Petra; Markéta PAVLÍKOVÁ; Lucie PIFKOVÁ; Robin JUGAS; Táňa MACHÁČKOVÁ; Lenka RADOVÁ; Milana SACHLOVA; Renata BARTOŠOVÁ; Tetiana SAMOILENKO; Zuzana FEČKOVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Erika SLÁMOVÁ; Elleni PONECHAL MICHU; Dagmar AL TUKMACHI; Michaela RUČKOVÁ; Martina VODINSKÁ; Jan KOTOUCEK; Tina CATELA IVKOVIĆ; Marie BOUDNÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Martin SVOBODA; Vladimír PROCHÁZKA; Tomáš GROLICH; Zdeněk KALA a Ondřej SLABÝ. Comprehensive profiling of lncRNAs and mRNAs enriched in small extracellular vesicles for early noninvasive detection of colorectal cancer: diagnostic panel assembly and extensive validation. MOLECULAR ONCOLOGY. HOBOKEN: WILEY, 2025, roč. 19, č. 11, s. 3445-3462. ISSN 1574-7891. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/1878-0261.70086.

ČARNOGURSKÁ, Martina; Valeriia Serhiivna VASYLIEVA; Táňa MACHÁČKOVÁ; Marie BOUDNÁ; Lucie PIFKOVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Ondřej SLABÝ; Beatrix BENCSIKOVA; Vlad POPOVICI a Eva BUDINSKÁ. Search for Mutations Connected With Non-Response to Anti-EGFR Therapy in mCRC in the Morphologically Defined Regions of Primary Tumours. Cancer Medicine. Houston: Wiley, 2025, roč. 14, č. 9, s. 1-12. ISSN 2045-7634. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/cam4.70910.

BUDINSKÁ, Eva; Martina ČARNOGURSKÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Táňa MACHÁČKOVÁ; Marie BOUDNÁ; Lucie PIFKOVÁ; Ondřej SLABÝ; Beatrix BENCSIKOVA a Vlad POPOVICI. An invasion front gene expression signature for higher-risk patient selection in stage IIA MSS colon cancer. Frontiers in Oncology. LAUSANNE: FRONTIERS MEDIA SA, 2024, roč. 14, April 2024, s. 1-8. ISSN 2234-943X. Dostupné z: https://doi.org/10.3389/fonc.2024.1367231.

BOUDNÁ, Marie; Táňa MACHÁČKOVÁ; Petra VYCHYTILOVÁ; Karolína TRACHTOVÁ; Renata BARTOŠOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Dagmar AL TUKMACHI; Robin JUGAS; Lucie PIFKOVÁ; Jana ORLÍČKOVÁ; Jan KOTOUČEK; Markéta PAVLÍKOVÁ; Milana ŠACHLOVÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Igor KISS; Tomáš GROLICH; Martin SVOBODA; Zdeněk KALA; Kamila SOUČKOVÁ a Ondřej SLABÝ. Investigation of long non-coding RNAs in extracellular vesicles from low-volume blood serum specimens of colorectal cancer patients. CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE. MILAN: SPRINGER-VERLAG ITALIA SRL, 2024, roč. 24, č. 1, s. 1-14. ISSN 1591-8890. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/s10238-024-01323-1.

VYCHYTILOVÁ, Petra; Sára VILMANOVÁ; Lucie PIFKOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Marie MĄDRZYK; Robin JUGAS; Táňa MACHÁČKOVÁ; Jan KOTOUČEK; Milana ŠACHLOVÁ; Lucia BOHOVICOVÁ; Teodor STANĚK; Jana HALÁMKOVÁ; Igor KISS a Ondřej SLABÝ. Optimized procedure for high-throughput transcriptome profiling of small extracellular vesicles isolated from low volume serum samples. Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. Berlin: WALTER DE GRUYTER, 2024, roč. 62, č. 1, s. 157-167. ISSN 1434-6621. Dostupné z: https://doi.org/10.1515/cclm-2023-0610.

BOUDNÁ, Marie; Andres DELGADO CAMPOS; Petra VYCHYTILOVÁ; Táňa MACHÁČKOVÁ; Ondřej SLABÝ a Kamila SOUČKOVÁ. Strategies for labelling of exogenous and endogenous extracellular vesicles and their application for in vitro and in vivo functional studies. Cell Communication and Signaling. LONDON: BMC, 2024, roč. 22, č. 1, s. 1-15. ISSN 1478-811X. Dostupné z: https://doi.org/10.1186/s12964-024-01548-3.

JURÁČEK, Jaroslav; Marie BOUDNÁ; Michal STANÍK; Michaela RUČKOVÁ; Karolína TRACHTOVÁ; Hana MALČÍKOVÁ; Eva LŽIČAŘOVÁ; Dominik A BARTH; Martin PICHLER a Ondřej SLABÝ. A tissue miRNA expression pattern is associated with disease aggressiveness of localized prostate cancer. Prostate. HOBOKEN: WILEY, 2023, roč. 83, č. 4, s. 340-351. ISSN 0270-4137. Dostupné z: https://doi.org/10.1002/pros.24466.

JURÁČEK, Jaroslav; Marie MĄDRZYK; Karolína TRACHTOVÁ; Michaela RUČKOVÁ; Júlia BOHOŠOVÁ; Dominik A. BARTH; Martin PICHLER; Michal STANÍK a Ondřej SLABÝ. Combination of Urinary MiR-501 and MiR-335 With Current Clinical Diagnostic Parameters as Potential Predictive Factors of Prostate Biopsy Outcome. CANCER GENOMICS & PROTEOMICS. ATHENS: INT INST ANTICANCER RESEARCH, 2023, roč. 20, č. 3, s. 308-316. ISSN 1109-6535. Dostupné z: https://doi.org/10.21873/cgp.20383.

BUDINSKÁ, Eva; Martina HRIVŇÁKOVÁ; Tina CATELA IVKOVIĆ; Marie BOUDNÁ; Rudolf NENUTIL; Beatrix BENCSIKOVÁ; Dagmar AL TUKMACHI; Michaela RUČKOVÁ; Lenka DUBSKÁ; Ondřej SLABÝ; Josef FEIT; Dragomir MIHNEA-PAUL; Petra BOŘILOVÁ LINHARTOVÁ; Sabine TEJPAR a Vlad POPOVICI. Molecular portraits of colorectal cancer morphological regions. eLife. CAMBRIDGE: ELIFE SCIENCES PUBL LTD, 2023, roč. 12, Nov, s. 1-20. ISSN 2050-084X. Dostupné z: https://doi.org/10.7554/eLife.86655.3.

MACHÁČKOVÁ, Táňa; Petra VYCHYTILOVÁ; Marie BOUDNÁ; Karolína TRACHTOVÁ; Marketa PAVLIKOVA; Jan KOTOUCEK; Jana HALÁMKOVÁ; Dagmar AL TUKMACHI; Jiří ŠÁNA; Petra POKORNÁ; Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Utility of RNA sequencing for transcriptome analysis of small extracellular vesicles derived from blood sera of colorectal cancer patients. In 114th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research (AACR). 2023. Dostupné z: https://doi.org/10.1158/1538-7445.AM2023-6709.

MĄDRZYK, Marie; Táňa MACHÁČKOVÁ; Karolína TRACHTOVÁ; Tina Catela IVKOVIĆ; Kamila SOUČKOVÁ; Jan KOTOUČEK; Josef MAŠEK; Tomáš LOJA; Milana ŠACHLOVÁ a Ondřej SLABÝ. Sekvenování dlouhých nekódujících RNA v exozomech u pacientů s kolorektálním karcinomem. Klinická onkologie. Praha: Česká lékařská společnost J. E. Purkyně, 2022, roč. 35, Supplementum 1, s. "S138"-"S141", 3 s. ISSN 0862-495X. Dostupné z: https://doi.org/10.48095/ccko20221S107.

JURÁČEK, Jaroslav; Marie MĄDRZYK; Michal STANÍK a Ondřej SLABÝ. Urinary microRNAs and Their Significance in Prostate Cancer Diagnosis: A 5-Year Update. CANCERS. MDPI, 2022, roč. 14, č. 13, s. 3157-3173. ISSN 2072-6694. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/cancers14133157.