Výpis publikací

LAPČÍK, Petr, Klára SYNKOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. A hybrid DDA/DIA-PASEF based assay library for a deep proteotyping of triple-negative breast cancer. Scientific Data. Nature Portfolio, 2024, roč. 11, č. 1, s. 794-800. ISSN 2052-4463. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41597-024-03632-2.

ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Lucia JANÁČOVÁ, Hlobilková ALICE, Kateřina JURÁSKOVÁ, Alexandr POPRACH, Hora MILAN, Fiala ONDŘEJ a Pavel BOUCHAL. Transmembrane glycoprotein GPNMB is a candidate predictive biomarker and potentially a therapeutic target in metastatic renal cell carcinoma. In Human Proteome Organization 2024. 2024.

JANÁČOVÁ, Lucia, Michaela ŠTENCKOVÁ, Petr LAPČÍK, Šárka HRACHOVINOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Roman HRSTKA, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. Catechol-O-methyl transferase suppresses cell invasion and interplays with MET signaling in estrogen dependent breast cancer. Scientific Reports. Nature Research, 2023, roč. 13, č. 1, s. 1-14. ISSN 2045-2322. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-023-28078-1.

LAPČÍK, Petr, Petr ŠULC, Lucia JANÁČOVÁ, Kateřina JÍLKOVÁ, David POTĚŠIL, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. Desmocollin-1 is associated with pro-metastatic phenotype of luminal A breast cancer cells and is modulated by parthenolide. Cellular & Molecular Biology Letters. BMC, 2023, roč. 28, č. 1, s. 1-25. ISSN 1425-8153. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s11658-023-00481-6.

LAPČÍK, Petr, Klára SYNKOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Library-based vs. library-free: a comprehensive DDA/diaPASEF hybrid assay library from triple-negative breast tumors for quantitative DIA data extraction in Spectronaut and DIA-NN. In In Book of Abstracts of 9th Informal Proteomic Meeting, Mělník 30.11.-1.12.2023, M05. 2023.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Jan ŠIMONÍK, Petr LAPČÍK, Lucia JANÁČOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Alice HLOBILKOVÁ, Vlad POPOVICI, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Next generation proteomics identifies a potential protein marker of poor response to tyrosine kinase inhibitors in metastatic renal cell carcinoma. In Abstract Book of EACR Conference: Cellular Bases for Patient Response to Cancer Therapies, Lyon, Francie 14.-16.11.2023, P12. 2023.

HRACHOVINOVÁ, Šárka, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Kateřina JURÁSKOVÁ, Vojtěch BYSTRÝ, Boris TICHÝ, Rudolf NENUTIL, Roman HRSTKA a Pavel BOUCHAL. Proteogenomic Classification of Triple-Negative Breast Cancer for Prognosis and Targeted Therapy. In Abstract Book of Doctoral conference 2023, Brno, CZ, 1.6.2023. 2023.

ŠIMONÍK, Jan, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Vlad POPOVICI, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteotype classification of localized and metastatic renal cell carcinoma for prognosis and therapy response. In Abstract Book of BSRP - EuPA Annual Scientific Meeting, Newcastle upon Tyne, UK, 17.-20.7.2023. 2023.

ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Richard ŠTEFANÍK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Vlad POPOVICI, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteotype classification of metastatic and localized renal cell carcinomas for prognosis and therapy response. In Abstract Book of XVIII. Czech Annual Cancer Research Meeting, Olomouc, CZ, 20.-22.11.2023. 2023. ISBN 978-80-908348-2-8.

ŠIMONÍK, Jan, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteotype classification of renal cell carcinoma for prognosis and therapy response. In Doctoral conference 2023, MUNI, Department of Biochemistry. 2023.

BOUCHAL, Pavel, Jan ŠIMONÍK, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH a Ondřej FIALA. Proteotypová klasifikace renálního karcinomu. In Sborník abstrakt (Klinická onkologie, ročník 36, Supplementum I), XLVII. Brněnské onkologické dny, Brno, CZ, 1.-3.11.2023, XXXI/81. 2023.

ŠIMONÍK, Jan, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Lucia JANÁČOVÁ, Alice HLOBILKOVÁ, Vlad POPOVICI, Alexandr POPRACH, Milan HORA, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Transmembrane glycoprotein GPNMB is a potential marker of poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase receptor inhibitor treatment. In 9th Informal Proteomic Meeting November 30 – December 1, Mělník, Masaryk Cultural House. 2023.

LAPČÍK, Petr, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues. Proteomics. Weinheim: Wiley-VCH GmbH, 2022, roč. 22, č. 7, s. "e2100228", 7 s. ISSN 1615-9853. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pmic.202100228.

BOUCHALOVÁ, Pavla a Pavel BOUCHAL. Current methods for studying metastatic potential of tumor cells. Cancer Cell International. BMC, 2022, roč. 22, č. 1, s. 1-22. ISSN 1475-2867. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1186/s12935-022-02801-w.

ŠIMONÍK, Jan, Petr LAPČÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. DIA-MS identifies proteins associated with a poor response of metastatic renal cell carcinoma to tyrosine kinase inhibitor treatment. In In Book of Abstracts of 14th European Summer School, Brixen, Italy 31.7.-6.8. 2022, p.46. 2022.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Lucia SOMMEROVÁ, David POTĚŠIL, Andrea MARTIŠOVÁ, Petr LAPČÍK, Veronika BRYCHTOVÁ, Alexander SCHERL, Petr VOŇKA, Joan PLANAS IGLESIAS, Eric CHEVET, Pavel BOUCHAL a Roman HRSTKA. Characterization of the AGR2 Interactome Uncovers New Players of Protein Disulfide Isomerase Network in Cancer Cells. Molecular & Cellular Proteomics. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2022, roč. 21, č. 2, s. 1-19. ISSN 1535-9484. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.mcpro.2021.100188.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Jan ŠIMONÍK, David POTĚŠIL, Petr LAPČÍK, Ján PODHOREC, Lucia JANÁČOVÁ, Milan HORA, Alice HLOBILKOVÁ, Alexandr POPRACH, Vlad POPOVICI, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteiny odpovědné za špatnou terapeutickou odpověď metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory. In Sborník abstrakt, přednášek a posterů, XXV. Biologické dny, Brno 5.- 6.9.2022, p. 40. 2022. ISSN 1805-9619.

ŠIMONÍK, Jan, Richard ŠTEFANÍK, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteotype classification of renal cell carcinoma for prognosis and therapy response. In In Book of Abstracts of 16the Central- and Eastern European Proteomic Conference, Praha 29.9.-1.10.2022, FrO-16. 2022.

LAPČÍK, Petr, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues. In 20th Human Proteome Organization World Congress, HUPO Reconnect 2021, Online, 15.11.-19.11.2021, in Book of Abstracts, p. 184. 2021.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Ondřej FIALA, Alexandr POPRACH a Pavel BOUCHAL. DIA-MS Identifies and Validates Transgelin as Protein Contributing to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment. In HUPO Reconnect 2021. 2021.

LAPČÍK, Petr, Kateřina JÍLKOVÁ, David POTĚŠIL, Lucia JANÁČOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, Roman HRSTKA, Rudolf NENUTIL a Pavel BOUCHAL. Knihovna cílených hmotnostně-spektrometrických assays pro proteotypovou klasifikaci trojitě negativních nádorů prsu získaná pomocí timsTOF Pro. In 7. Neformální proteomické setkání, Hradec Králové, 25.11.-26.11.2021, in Book of Abstracts, p. 24. 2021.

LAPČÍK, Petr, Pavla BOUCHALOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Milan HORA, Alexandr POPRACH, Ondřej FIALA a Pavel BOUCHAL. Proteotypová analýza renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi. In 7. Neformální proteomické setkání, 25.-26.11.2021, Hradec Králové, In Book of Abstracts, p. 24. 2021.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Alexandr POPRACH a Pavel BOUCHAL. Transgelin Contributes to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment. Biomedicines. Basel: MDPI, 2021, roč. 9, č. 9, s. 1145-1163. ISSN 2227-9059. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.3390/biomedicines9091145.

LAPČÍK, Petr, Petr ŠULC, Jakub FAKTOR, Lucia JANÁČOVÁ, Kateřina JÍLKOVÁ, David POTĚŠIL, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. Desmocollin-1 plays a role in breast cancer cell migration, invasion and metastasis and is modulated by parthenolide. In 19th Human Proteome Organization World Congress, HUPO Connect 2020, Online, 19..10-22.10.2020, in Book of Abstracts, p. 56. 2020.

FARKA, Zdeněk, Matthias Jürgen MICKERT, Zuzana MIKUŠOVÁ, Antonín HLAVÁČEK, Pavla BOUCHALOVÁ, Wenshu XU, Pavel BOUCHAL, Petr SKLÁDAL a Hans-Heiner GORRIS. Surface design of photon-upconversion nanoparticles for high-contrast immunocytochemistry. Nanoscale. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 2020, roč. 12, č. 15, s. 8303-8313. ISSN 2040-3364. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1039/C9NR10568A.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Alexandr POPRACH a Pavel BOUCHAL. Transgelin contributes to a poor response of metastatic renal cell carcinoma to sunitinib treatment. In In Book of Abstract of: 19th Human Proteome Organization World Congress, HUPO Connect 2020, October 19-22, 2020, p. 45. 2020.

BOUCHAL, Pavel, Pavla BOUCHALOVÁ, Jindřich BERÁNEK, Petr LAPČÍK, David POTĚŠIL, Ján PODHOREC, Ondřej FIALA a Alexandr POPRACH. Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory. In Book of Abstract of: Neformální proteomický webinář. 27.11.2020, str. 10. 2020.

DVOŘÁKOVÁ, Monika, Petr LAPČÍK, Pavla BOUCHALOVÁ a Pavel BOUCHAL. Transgelin Silencing Induces Different Processes in Different Breast Cancer Cell Lines. Proteomics. Hoboken: Wiley, 2020, roč. 20, č. 7, s. 1-8. ISSN 1615-9853. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pmic.201900383.

FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, Vendula PÁRALOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr BENEŠ a Pavel BOUCHAL. Mass spectrometry identification and validation of cell surfaceome associated with breast cancer cell migration and metastasis. In Keystone Symposia: Proteomics and its Application to Translational and Precision Medicine. Stockholm, Sweden, 7.-11.4.2019, in Book of Poster Abstracts, poster 1043. 2019.

LAPČÍK, Petr, Petr ŠULC, Lenka ČÁPKOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, David POTĚŠIL, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. On the molecular role of desmocollin-­1 in lymph node metastasis of luminal A breast cancer. In 13th European Summer School on Advanced Proteomics. 28.7.-3.8.2019, Brixen, Italy, in Book of Abstracts, p. 30. 2019.

FAKTOR, Jakub, Lucia KNOPFOVÁ, Petr LAPČÍK, Lucia JANÁČOVÁ, Vendula PÁRALOVÁ, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER, Petr BENEŠ a Pavel BOUCHAL. Proteomics Identification and Validation of Desmocollin-1 and Catechol-O-Methyltransferase as Proteins Associated with Breast Cancer Cell Migration and Metastasis. Proteomics. HOBOKEN, USA: Wiley, 2019, roč. 19, 21-22, s. 1-11. ISSN 1615-9853. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1002/pmic.201900073.

LAPČÍK, Petr, Petr ŠULC, Lenka ČÁPKOVÁ, Lucia JANÁČOVÁ, Kateřina JÍLKOVÁ, David POTĚŠIL, Pavla BOUCHALOVÁ, Petr MÜLLER a Pavel BOUCHAL. The mechanisms of pro-metastatic role of desmocollin-1 in luminal breast cancer. In XX. setkání biochemiků a molekulárních biologů, 12.-13.11.2019, in Book of Abstracts, p. 38. 2019.

SOMMEROVA, Lucia, Milan ANTON, Pavla BOUCHALOVÁ, Hedvika JASICKOVA, Vladimír RAK, Eva JANDÁKOVÁ, Iveta SELINGEROVÁ, Martin BARTOSIK, Bořivoj VOJTĚŠEK a Roman HRSTKA. The role of miR-409-3p in regulation of HPV16/18-E6 mRNA in human cervical high-grade squamous intraepithelial lesions. ANTIVIRAL RESEARCH. AMSTERDAM: ELSEVIER SCIENCE BV, 2019, roč. 163, MAR 2019, s. 185-192. ISSN 0166-3542. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.1016/j.antiviral.2019.01.019.

BOUCHALOVÁ, Pavla, Pavel BOUCHAL, Alexander SCHERL, David POTĚŠIL, Lenka HERNYCHOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK a Roman HRSTKA. Identification of AGR2 partners using mass spectrometry with label-free quantification. In 3rd RECAMO joint meeting: Role of p53, MDM2, AGR2/3 and ubiquitin/chaperone systems in tumour biology. 2012.

HUBLAROVÁ, Pavla, Kristína GREPLOVÁ, Jitka HOLČÁKOVÁ, Bořivoj VOJTĚŠEK a Roman HRSTKA. SWITCHING p53-DEPENDENT GROWTH ARREST TO APOPTOSIS VIA THE INHIBITION OF DNA DAMAGE-ACTIVATED KINASES. Cellular & Molecular Biology Letters. Wrocław, 2010, roč. 15, č. 3, s. 473-484. ISSN 1425-8153. Dostupné z: https://dx.doi.org/10.2478/s11658-010-0021-5.

ROTTER, Leopold, Pavla ROTTEROVÁ a Pavla HUBLAROVÁ. Perzistující abnormální cytologický nález v endocervikální lokalizaci. In 17. sjezd českých a slovenských patologů 2009. 2009. ISBN 978-80-7392-112-5.

HUBLAROVÁ, Pavla, Roman HRSTKA, Pavla ROTTEROVÁ, Leopold ROTTER, Marie ČOUPKOVÁ, Vinay BADAL, Rudolf NENUTIL a Bořivoj VOJTĚŠEK. Prediction of human papillomavirus 16 e6 gene expression and cervical intraepithelial neoplasia progression by methylation status. International Journal of Gynecologic Cancer. United States: Int J Gynecol Cancer, 2009, roč. 19, č. 3, s. 321-325. ISSN 1048-891X.

ROTTEROVÁ, Pavla, Leopold ROTTER, Pavla HUBLAROVÁ, Markéta HERMANOVÁ a Rudolf NENUTIL. Nové možnosti detekce proteinu p16. In 16. zjazd Slovenských a Českých patológov. 2008.

VESELSKÁ, Renata, Petr KUGLÍK, Pavel CEJPEK, Pavla HUBLAROVÁ, Hana ŠVÁCHOVÁ, Eva DVOŘÁKOVÁ, Jakub NERADIL a Jiřina RELICHOVÁ. Establishment and characterization of a new cell line derived from human high-grade astrocytoma. In 9th European Workshop on Cytogenetics of Human Solid Tumours - Book of abstracts. Brno: Kongresové centrum Brno, 2004, s. 78. ISBN 80-86607-12-7.

VESELSKÁ, Renata, Petr KUGLÍK, Pavel CEJPEK, Pavla HUBLAROVÁ, Hana ŠVÁCHOVÁ a Jiřina RELICHOVÁ. Nestin expression in cell lines derived from high-grade astrocytomas. In International Journal of Mol. Medicine 14 (Sup. 1) - the 9th World Congress on Advances in Oncology and the 7th International Symposium on Molecular Medicine. Athens: Spandidos Ltd., 2004, s. S21, 1 s. ISSN 1107-3756.

VESELSKÁ, Renata, Petr KUGLÍK, Pavla HUBLAROVÁ, Hana ŠVÁCHOVÁ, Jiřina RELICHOVÁ a Pavel CEJPEK. Kultivace buněk solidních tumorů in vitro pro účely genetické diagnostiky. In Sborník abstrakt - Mefa. 2003.

KUGLÍK, Petr, Renata VESELSKÁ, Pavla HUBLAROVÁ, Hana ŠVÁCHOVÁ, Martina PEŠÁKOVÁ, Alexandra OLTOVÁ, Jiřina RELICHOVÁ a Pavel CEJPEK. Molecular cytogenetic and immunochemical study of high-grade astrocytomas. In Annales de Genetique. 2003.

VESELSKÁ, Renata, Petr KUGLÍK, Pavla HUBLAROVÁ, Hana ŠVÁCHOVÁ, Eva LŽIČAŘOVÁ, Jiřina RELICHOVÁ a Pavel CEJPEK. Nestin expression in cell lines derived from high-grade astrocytomas. In XI. Cytoskeletální klub. 2003.