Filtrování

    2009

    1. ŠIMARA, Pavel; Irena KOUTNÁ; Stanislav STEJSKAL; Petr KRONTORÁD; Zdeněk RUČKA; Martina PETERKOVÁ a Michal KOZUBEK. Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling. Neoplasma. Bratislava, Slovensko: AEPress, s.r.o., 2009, roč. 2/2009, č. 56, s. 141-149. ISSN 0028-2685.
      Odborný vědecký článek
      Název česky: Kombinace mRNA a proteinové microarray analýzy v komplexním profilování buněk
      Název anglicky: Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling
      RIV/00216224:14330/09:00034277 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Šimara, Pavel (203 Česká republika, domácí) -- Koutná, Irena (203 Česká republika, garant, domácí) -- Stejskal, Stanislav (203 Česká republika, domácí) -- Krontorád, Petr (203 Česká republika, domácí) -- Ručka, Zdeněk (203 Česká republika, domácí) -- Peterková, Martina (203 Česká republika, domácí) -- Kozubek, Michal (203 Česká republika, domácí)
      Klíčová slova anglicky: microarray; cell profiling; protein expression; mRNA expression; HL-60
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Pavel Šimara, Ph.D., učo 67594. Změněno: 2. 3. 2018 09:49.
    2. BUDINSKÁ, Eva; Eva GELNAROVÁ a Michael G. SCHIMEK. MSMAD: a computationally efficient method for the analysis of noisy array CGH data. Bioinformatics. Oxford University Press, 2009, roč. 25, č. 6, s. 703-713. ISSN 1367-4803.
      URL
      Název česky: MSMAD: výpočetně efektivní metoda pro analýzu dat arrayCGH
      RIV/00216224:14110/09:00035237 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Velká Británie a Severní Irsko.
      Budinská, Eva (703 Slovensko, garant) -- Gelnarová, Eva (203 Česká republika) -- Schimek, Michael G. (40 Rakousko)
      Klíčová slova anglicky: MSMAD; microarray; arrayCGH; median absolute deviation; median smoothing
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnila: Mgr. Eva Budinská, Ph.D., učo 40822. Změněno: 19. 3. 2009 14:17.

    2008

    1. STEJSKAL, Stanislav; Pavel MATULA; Irena KOUTNÁ; Ondřej DANĚK; Martin MAŠKA a Michal KOZUBEK. The Use of RNA Polymerase II in Epigenetic Analysis. In 3rd EFS Functional Genomics Conference 2008. 2008.
      Název česky: Použití RNA Polymerasy II v epigenetické analýze
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Rakousko.
      Klíčová slova anglicky: RNA Polymerase II; granulopoiesis; ImmunoFISH;microarray;image analysis
      Druh účasti: aktivní účast
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: Mgr. Stanislav Stejskal, Ph.D., učo 67623. Změněno: 18. 12. 2008 13:22.

    2007

    1. GARAJOVÁ, Ingrid; Marek SVOBODA; Ondřej SLABÝ; Eva KREJČÍ; Ilona KOCÁKOVÁ; Markéta BEDNAŘÍKOVÁ; Roman ŠEFR a Rostislav VYZULA. DNA microarray analysis of locally advanced rectal adenocarcinomas: prediction of sensitivity to neoadjuvant chemoradiotherapy. In III. dny diagnostické, prediktivní a experimentální onkologie. Sborník příspěvků. 2007. vyd. Olomouc: Solen, 2007, s. 24-24. ISBN 978-80-244-1824-7.
      Název česky: DNA-čipová analýza lokálne pokročilých adenokarcinomů rekta:predikce senzitivity k neoadjuvatní chemoradioterapii
      Název anglicky: DNA microarray analysis of locally advanced rectal adenocarcinomas: prediction of sensitivity to neoadjuvant chemoradiotherapy.
      Onkologie a hematologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: microarray;rectal adenocarcinoma;neoadjuvant therapy
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. MUDr. Marek Svoboda, Ph.D., učo 19402. Změněno: 19. 12. 2007 01:38.
    2. KILIAN, Joachim; Dion WHITEHEAD; Jakub HORÁK; Dierk WANKE; Stefan WEINL; Oliver BATISTIC; Cecilia D´ANGELO; Erich BORNBERG-BAUER; Jörg KUDLA a Klaus HARTER. The AtGenExpress global stress expression data set: protocols, evaluation and model data analysis of UV-B light, drought and cold stress responses. The Plant Journal. England: BLACKWELL PUBLISHING, 2007, roč. 50, č. 2, s. 347-363. ISSN 0960-7412.
      URL
      RIV/00216224:14310/07:00035260 Článek v odborném periodiku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Spojené státy.
      Kilian, Joachim (276 Německo) -- Whitehead, Dion (826 Velká Británie a Severní Irsko) -- Horák, Jakub (203 Česká republika, garant) -- Wanke, Dierk (276 Německo) -- Weinl, Stefan (276 Německo) -- Batistic, Oliver (276 Německo) -- D´Angelo, Cecilia (380 Itálie) -- Bornberg-Bauer, Erich (276 Německo) -- Kudla, Jörg (276 Německo) -- Harter, Klaus (276 Německo)
      Klíčová slova anglicky: AtGenExpress; bioinformatics; gene expression; microarray; abiotic stress
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: Mgr. Jakub Horák, Dr. rer. nat., učo 21777. Změněno: 12. 4. 2010 08:43.
    3. TransMap Viewer (software)
      URL
      Název česky: TransMap Viewer
      RIV: Software. Využití počítačů, robotika a její aplikace. angličtina. Česká republika.
      Strehovský, Michal (703 Slovensko, garant, domácí) -- Krontorád Koutná, Irena (203 Česká republika) -- Krontorád, Petr (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: microarray; transcription density map
      Mezinárodní význam: ano

      Změnil: RNDr. Pavel Šmerk, Ph.D., učo 3880. Změněno: 31. 3. 2015 14:11.

    2006

    1. SCHIMEK, Michael a Tomáš PAVLÍK. A comparative study of false discovery rate procedures in R. In Proceedings of the 21th International Workshop on Statistical Modelling. Galway, Ireland, 3-7 July 2006. 21. vyd. Galway, Ireland: Statistical Modelling Society, 2006, s. 466-473. ISBN 1-86220-180-3.
      Název česky: Srovnávací studie FDR procedur v jazyce R
      Název anglicky: A comparative study of false discovery rate procedures in R
      Aplikovaná statistika, operační výzkum. angličtina. Irsko.
      Klíčová slova anglicky: Correlation; Error control; False Discovery Rate; Microarray
      Druh sborníku: předkonferenční sborník
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: RNDr. Tomáš Pavlík, Ph.D., učo 52483. Změněno: 1. 4. 2010 09:20.
    2. ŠERÝ, Omar a Petr ZVOLSKÝ. Historický přehled vzniku molekulární psychiatrie. Česká a slovenská psychiatrie. Praha: ČLS J.E. Purkyně, 2006, roč. 102, č. 5, s. 246-249. ISSN 1212-0383.
      Název česky: Historický přehled vzniku molekulární psychiatrie
      Název anglicky: Historic overview of establishment of molecular psychiatry
      RIV/00216224:14310/06:00016681 Článek v odborném periodiku. Neurologie, neurochirurgie, neurovědy. čeština. Česká republika.
      Šerý, Omar (203 Česká republika, garant) -- Zvolský, Petr (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: molecular psychiatry; history; psychopharmacology; genetics; PCR; DNA; genome; microarray; Cajal; Gall; Mendel
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Omar Šerý, Ph.D., učo 18120. Změněno: 13. 2. 2008 17:31.
    3. TICHÝ, Boris; M. SVOBODA; Jiří MAYER a Šárka POSPÍŠILOVÁ. Odběr a zpracování vzorků pro expresní DNA čipy. Klinická onkologie. 2006, roč. 19, suppl, s. 346-350. ISSN 1802-5307.
      Název anglicky: Sample taking and processing for expression DNA microarrays
      RIV/00216224:14310/06:00028311 Článek v odborném periodiku. Onkologie a hematologie. čeština. Česká republika.
      Tichý, Boris (203 Česká republika, garant) -- Svoboda, M. (203 Česká republika) -- Mayer, Jiří (203 Česká republika) -- Pospíšilová, Šárka (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: RNA; microarray; biopsy; gene expression
      Recenzováno: ano

      Změnila: RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D., učo 14364. Změněno: 26. 7. 2010 13:49.

    2005

    1. BUDINSKÁ, Eva a Eva GELNAROVÁ. A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data. In EnviroInfo Brno 2005. Networking Environmental Information. Part 2. Proceedings of the 19th International Conference Informatics for Environmental Protection. Brno: Masaryk University in Brno, 2005, s. 673 - 676. ISBN 80-210-3780-6.
      Název česky: Metoda detekce bodů zlomu u array CGH dat
      Název anglicky: A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data
      Aplikovaná statistika, operační výzkum. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: array CGH; breakpoint detection; analysis; microarray

      Změnila: RNDr. Eva Gelnarová, učo 133275. Změněno: 28. 4. 2006 19:26.
    2. KOUTNÁ, Irena; Eva JANSOVÁ; Petr KRONTORÁD; Zbyněk SVOBODA; Michal KOZUBEK a Stanislav KOZUBEK. cDNA Microarray Technology as a Tool for Better Understanding of Progress of Malignant Diseases. In Prague Post Genome Technology Workshop. Prague, Czech Republic: Czech Pattern Recognition Society, 2005, s. 69-72. ISBN 80-01-03239-6.
      Název česky: cDNA microarray technologie jako nástroj k lepšímu pochopení progrese maligních onemocnění
      RIV/00216224:14330/05:00013836 Stať ve sborníku. Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Koutná, Irena (203 Česká republika) -- Jansová, Eva (203 Česká republika) -- Krontorád, Petr (203 Česká republika) -- Svoboda, Zbyněk (203 Česká republika) -- Kozubek, Michal (203 Česká republika, garant) -- Kozubek, Stanislav (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: microarray
      Mezinárodní význam: ano
      Recenzováno: ano

      Změnil: prof. RNDr. Michal Kozubek, Ph.D., učo 3740. Změněno: 7. 5. 2010 09:29.
    3. LIDMAN, Petr; Zdenko STANÍČEK; Filip PROCHÁZKA; Eva BUDINSKÁ; Jiří JARKOVSKÝ a Ladislav DUŠEK. Projekt EMIL (Effective Microarray IntelLigence): přínos metod umělé inteligence pro analýzu microarrays. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno: Česká společnost pro analytickou cytologii, 2005, s. 107-108. ISBN 80-239-5155-6.
      Název anglicky: Project EMIL (Effective Microarray IntelLigence): benefits of artificial intelligence methods for microarray analysis
      RIV/00216224:14330/05:00013455 Stať ve sborníku. Informatika. čeština. Česká republika.
      Lidman, Petr (203 Česká republika) -- Staníček, Zdenko (203 Česká republika) -- Procházka, Filip (203 Česká republika) -- Budinská, Eva (703 Slovensko) -- Jarkovský, Jiří (203 Česká republika) -- Dušek, Ladislav (203 Česká republika, garant)
      Klíčová slova anglicky: microarray; microarrays; artificial intelligence; uiron; oncology; machine learning; intelligent assistant

      Změnil: Mgr. Petr Lidman, učo 3619. Změněno: 6. 2. 2006 18:00.
    4. LIDMAN, Petr; Zdenko STANÍČEK; Filip PROCHÁZKA; Jan MUŽÍK; Ladislav DUŠEK; Rostislav VYZULA a Pavel ANDRES. Projekt UIRON ("Universal information robot in oncology"): přínos metod umělé inteligence v biomedicíně a klinické praxi. In Vybrané otázky onkologie IX. Praha: Galén, 2005, s. 143-144. ISBN 80-7262-382-6.
      Název anglicky: Project UIRON ("Universal information robot in oncology"): benefits of artificial intelligence methods in biomedicine & clinical practice
      RIV/00216224:14330/05:00013457 Stať ve sborníku. Informatika. čeština. Česká republika.
      Lidman, Petr (203 Česká republika) -- Staníček, Zdenko (203 Česká republika) -- Procházka, Filip (203 Česká republika) -- Mužík, Jan (203 Česká republika) -- Dušek, Ladislav (203 Česká republika, garant) -- Vyzula, Rostislav (203 Česká republika) -- Andres, Pavel (203 Česká republika)
      Klíčová slova anglicky: biomedicine; epidemiology; national cancer register; microarray; microarrays; artificial intelligence; uiron; oncology; machine learning; intelligent assistant; business rules engine

      Změnil: Mgr. Petr Lidman, učo 3619. Změněno: 6. 2. 2006 18:39.
    5. LIDMAN, Petr; Zdenko STANÍČEK; Filip PROCHÁZKA; Ladislav DUŠEK; Jiří JARKOVSKÝ a Eva BUDINSKÁ. Rule-based systems: employing intelligent computer assistant in biomedicine & clinical practice. In Proceedings of 1st International Summer School on Computational Biology. Brno: Masarykova univerzita, 2005, s. 100-104. ISBN 80-210-3907-8.
      Název česky: Pravidlové systémy: využití inteligentního počítačového asistenta v biomedicíně a klinické praxi
      RIV/00216224:14330/05:00013456 Stať ve sborníku. Informatika. angličtina. Česká republika.
      Lidman, Petr (203 Česká republika) -- Staníček, Zdenko (203 Česká republika) -- Procházka, Filip (203 Česká republika) -- Dušek, Ladislav (203 Česká republika, garant) -- Jarkovský, Jiří (203 Česká republika) -- Budinská, Eva (703 Slovensko)
      Klíčová slova anglicky: biomedicine; epidemiology; national cancer register; microarray; microarrays; artificial intelligence; uiron; oncology; machine learning; intelligent assistant; business rules engine

      Změnil: Mgr. Petr Lidman, učo 3619. Změněno: 6. 2. 2006 18:42.
    6. WEINSTOCK, George M.; David ŠMAJS; Petra MATĚJKOVÁ; Michal STROUHAL; Thomas J. ALBERT; Steven J. NORRIS; Timothy PALZKILL a Erica J. SODERGREN. Treponema Genomics. In Molecular Biology of Spirochetes. Praha: Státní zdravotní ústav., 2005, s. 96-100. Volume 373 NATO Science Series. ISBN 1-58603-665-3.
      Název česky: Genomika treponem.
      Genetika a molekulární biologie. angličtina. Česká republika.
      Klíčová slova anglicky: DNA sequence; comparative genomics; syphilis; yaws; microarray

      Změnila: Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D., učo 12972. Změněno: 26. 6. 2009 16:28.