Výpis publikací

2024

1. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Katarína GREŠOVÁ; Jaroslav OĽHA; Vlastislav DOHNAL; Adrián ROŠINEC a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.d35zf-1ja47.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441963/cs
2. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

   SLANINÁKOVÁ, Terézia; Katarína GREŠOVÁ; David PROCHÁZKA; Viktória SPIŠAKOVÁ; Adrián ROŠINEC; Jakub ČILLÍK; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Aleš KŘENEK; Vlastislav DOHNAL; Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441958/cs
3. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439240/cs
4. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439238/cs
5. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439241/cs
6. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.tbws0-hj147.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441960/cs
7. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441959/cs
8. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas

   NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas. 2024.

   Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2436500/cs