GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.

Základní údaje

Originální název

GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

Autoři

NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC ORCID; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL ORCID

Vydání

2024

---

Další údaje

Jazyk

angličtina

Typ výsledku

Projekty výzkumu a vývoje

Obor

10201 Computer sciences, information science, bioinformatics

Stát vydavatele

Česká republika

Utajení

není předmětem státního či obchodního tajemství

Odkazy

URL

Organizační jednotka

Fakulta informatiky

Klíčová slova anglicky

protein structure;similarity search;AlphaFold;embeddings;AlphaFind

Štítky

AlphaFind, AlphaFold, CODA Research Group, embeddings, LMI, protein structure, similarity search

Příznaky

Mezinárodní význam

---

Návaznosti

GF23-07040K, projekt VaV	Název: Naučené indexy pro podobností hledání Investor: Grantová agentura ČR, Naučené indexy pro podobností hledání, Lead agentura
LM2023055, projekt VaV	Název: Česká národní infrastruktura pro biologická data Investor: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR, ELIXIR-CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data
MUNI/A/1590/2023, interní kód MU	Název: Využití technik umělé inteligence pro zpracování dat, komplexní analýzy a vizualizaci rozsáhlých dat Investor: Masarykova univerzita, Využití technik umělé inteligence pro zpracování dat, komplexní analýzy a vizualizaci rozsáhlých dat
752/2024, interní kód MU	Název: Nástroj na automatickou anotaci a prohledávání velkých sad proteinů na základě podobnosti jejich struktur Investor: CESNET, Nástroj na automatickou anotaci a prohledávání velkých sad proteinů na základě podobnosti jejich struktur
90254, velká výzkumná infrastruktura	Název: e-INFRA CZ II