Filtrování

    2024

    1. AlphaFind (software)
      SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Jakub ČILLÍK; Lucie NOVOTNÁ a Adrián ROŠINEC. AlphaFind. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.5281/zenodo.11085862.
    2. SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Jaroslav OĽHA; Adrián ROŠINEC; Katarína GREŠOVÁ; Jakub ČILLÍK; Miriama JÁNOŠOVÁ; Jana PORUBSKÁ; Radka SVOBODOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In Elixir All-Hands 2024. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.7490/f1000research.1119872.1.
    3. NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Katarína GREŠOVÁ; Jaroslav OĽHA; Vlastislav DOHNAL; Adrián ROŠINEC a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.d35zf-1ja47.
    4. PROCHÁZKA, David; Terézia SLANINÁKOVÁ; Jaroslav OĽHA; Adrián ROŠINEC; Katarína GREŠOVÁ; Miriama JÁNOŠOVÁ; Jakub ČILLÍK; Jana PORUBSKÁ; Radka SVOBODOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. Nucleic acids research. Oxford: Oxford University Press, 2024, roč. 52, W1, s. "W182"-"W186", 5 s. ISSN 0305-1048. Dostupné z: https://doi.org/10.1093/nar/gkae397.
    5. SLANINÁKOVÁ, Terézia; Katarína GREŠOVÁ; David PROCHÁZKA; Viktória SPIŠAKOVÁ; Adrián ROŠINEC; Jakub ČILLÍK; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Aleš KŘENEK; Vlastislav DOHNAL; Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.
    6. NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.tbws0-hj147.
    7. NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.
Zobrazit podrobně