-
AlphaFind (software)SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Jakub ČILLÍK; Lucie NOVOTNÁ a Adrián ROŠINEC. AlphaFind. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.5281/zenodo.11085862.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441942/cs
-
SLANINÁKOVÁ, Terézia; David PROCHÁZKA; Jaroslav OĽHA; Adrián ROŠINEC; Katarína GREŠOVÁ; Jakub ČILLÍK; Miriama JÁNOŠOVÁ; Jana PORUBSKÁ; Radka SVOBODOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB. In Elixir All-Hands 2024. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.7490/f1000research.1119872.1.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441940/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Katarína GREŠOVÁ; Jaroslav OĽHA; Vlastislav DOHNAL; Adrián ROŠINEC a Matej ANTOL. AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.d35zf-1ja47.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441963/cs
-
SLANINÁKOVÁ, Terézia; Katarína GREŠOVÁ; David PROCHÁZKA; Viktória SPIŠAKOVÁ; Adrián ROŠINEC; Jakub ČILLÍK; Pavlína ŠPRINGEROVÁ; Aleš KŘENEK; Vlastislav DOHNAL; Radka SVOBODOVÁ a Matej ANTOL. Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository. In ELIXIR CZ Annual Conference. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.13140/RG.2.2.31355.53281.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441958/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439240/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439238/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2439241/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.tbws0-hj147.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441960/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4. 2024. Dostupné z: https://doi.org/10.48700/datst.t45hr-bcw17.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2441959/cs
-
NOVOTNÁ, Lucie; Terézia SLANINÁKOVÁ; David PROCHÁZKA; Lukáš HEJTMÁNEK; Adrián ROŠINEC; Jaroslav OĽHA; Katarína GREŠOVÁ; Vlastislav DOHNAL a Matej ANTOL. 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas. 2024.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/2436500/cs
-
LEXA, Matej; Václav SNÁŠEL a Ivan ZELINKA. Data-mining protein structure by clustering, segmentation and evolutionary algorithms. In Data Mining: Theoretical Foundations and Applications. Germany: Springer Verlag, 2009, s. 221-248. ISBN 978-3-642-01087-3. Dostupné z: https://doi.org/10.1007/978-3-642-01088-0_10.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/831677/cs
-
FOJTA, Miroslav; Sabina BILLOVÁ; Luděk HAVRAN; Hana PIVOŇKOVÁ; Hana ČERNOCKÁ; Petra HORÁKOVÁ a Emil PALEČEK. Osmium Tetroxide, 2,2´-Bipyridine: Electroactive Marker for Probing Accessibility of Tryptophan Residues in Proteins. Analytical Chemistry. USA: Amer Chemical Soc, 2008, roč. 80, č. 12, s. 4598-4605. ISSN 0003-2700.Podrobněji: https://is.muni.cz/publication/813837/cs