Diplomová práce

Využití mikrohaplotypů pro určení příbuzenství u historických populací

Microhaplotypes as a tool for kinship testing in historical populations

Bc. Kateřina Vacenovská
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá výběrem a následnou aplikací mikrohaplotypů na starobylou DNA. Její součástí je optimalizace metod pro využití těchto genetických markerů za účelem určení příbuzenství prvního stupně. Na základě literární rešerše byly jako nejvhodnější pro analýzu vyhodnoceny výhradně Multi-Indely, které jsou považovány za „generalizované mikrohaplotypy“. Z celkového počtu 198 dostupných …více

Abstract

This thesis deals with the selection and subsequent application of microhaplotypes to ancient DNA. It includes the optimization of methods for the use of these genetic markers to determine first-degree relationships. Based on a literature search, only Multi-Indels, which are considered as "generalized microhaplotypes", were evaluated as the most suitable for analysis. Out of 198 available loci, 14 …více

Zadání práce
Mikrohaplotypy a inzerce/delece (InDel) jsou genetické markery s potenciálem pro individuální identifikaci jedinců, které dnes mohou vhodně doplnit tradičně využívané STR markery. Vzhledem ke svým vlastnostem je vhodné jejich použití u degradované DNA. Mikrohaplotypy a InDel polymorfismy se v porovnání s STR vyznačují kratší délkou, což je činí perspektivními pro použití u aDNA. Cílem práce je na základě literární rešerše vybrat mikrohaplotypy a/nebo InDel polymorfismy vhodné pro analýzy aDNA. Následně optimalizovat metodiku analýzy zmíněných genetických markerů za účelem testování příbuzenství prvního stupně jedinců z historických kosterních pozůstatků.
Práce zkontrolována:
15. 5. 2025 13:55, Mgr. et Mgr. Lenka Falk, Ph.D., učo 151401
Plný text práce
1,6 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
19. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. et Mgr. Lenka Falk, Ph.D., učo 151401
Genet ÚEB Biol PřF MU

Oponent

Ing. Irena Vrtková, Ph.D.
Ústav morfologie, fyziologie a genetiky zvířat, Agronomická fakulta, Mendelova univerzita.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.