Bakalářská práce

Softwarové nástroje pro práci s metaloproteiny

Software tools for processing of metalloproteins

Michal Kovář, učo 207905
Anotace

Cílem této bakalářské práce je návrh a implementace softwarových nástrojů pro práci s molekulami metaloproteinů. V rámci práce byly vytvořeny tři moduly, které slouží ke zpracování dat o molekulách metaloproteinů, konkrétně: Modul pro nalezení molekul metaloproteinů v rámci databáze Protein DataBank a jejich iniciální download, modul pro výpis statistik o metaloproteinech a modul pro pravidelný update informací o metaloproteinech.

Abstract

The aim of this thesis is the design and implementation of software tools for processing molecules of metalloproteins. In this work were developed three modules that are used to process metalloproteins data, namely: Module for finding molecules of metalloproteins in the Protein Databank database and their initial download, the module for list and statistics of metalloproteins and module for regular updates of metalloproteins database.

Klíčová slova
Proteiny metaloproteiny Protein DataBank MetaloProtein DataBank statistika databáze molekula
Zadání práce
Velmi významnými molekulami v buňkách živých organismů jsou proteiny. Část těchto molekul obsahuje ve svých aktivních místech atom kovu. Tyto proteiny se nazývají metaloproteiny a informace o jejich chemické struktuře lze nalézt v rámci databáze proteinů (Protein DataBank). V současné době je však tato databáze velmi rozsáhlá, obsahuje netriviální množství molekul metaloproteinů a nemá žádné nástroje specializované na práci s metaloproteiny.
Cílem bakalářské práce je navrhnout a implementovat softwarové nástroje, které umožní snadnou práci s molekulami metaloproteinů, konkrétně:
  • Program pro nalezení molekul metaloproteinů v rámci Protein DataBank a jejich iniciální download
  • Program pro výpis statistik o metaloproteinech
  • Program pro pravidelný update informací o metaloproteinech
    • Administrativní informace
    Práce zkontrolována:
    1. 3. 2010 21:03, prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
    Plný text práce
    638,8 KB / soubor PDF
    Jazyk práce
    čeština čeština
    Termín obhajoby
    24. 6. 2010
    Práce byla úspěšně obhájena

    Vedoucí

    prof. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D., učo 4056
    NCBR PřF MU

    Oponent

    Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
    abs PřF MU
    Citovat tuto práci
    Masarykova univerzita Fakulta informatiky
    Studijní program
    Aplikovaná informatika
    Obor

    Práce na příbuzné téma

    Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

    Podobné práce

    • Přidání souboru

      Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

    • Další operace se soubory

      Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

    • Pohled pro experty

      Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

    • Vyhledávání souborů

      Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

    • Rychlý přístup k souborům

      Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.