Diplomová práce

Vývoj metod virtuálního screeningu pro hledání vysokoafinitních ligandů

Development of Virtual Screening for High-affinity Ligand Search

Bc. Matej Medvecký, učo 356979
Anotace

Virtuální screening (VS) je populární metodou pro selekci potenciálních léčiv v počáteční fázi procesu objevování nových léků. Využívá počítačové programy k předpovědi vazebných afinit ligandů k cílovému receptoru. Kombinací VS s experimentálním testováním se výrazně šetří náklady a čas potřebný k identifikaci nových léčiv. Tato práce je zaměřena na vývoj nástrojů na zvýšení rychlosti a přesnosti VS …více

Abstract

Virtual screening (VS) is an important and popular method for selection of candidate lead molecules in early stage of drug discovery process. It uses computer programs to predict binding affinities of ligands to a target receptor. Combination of VS with experimental high-throughput screening significantly reduce both cost and time required for identification of novel lead compounds. This work focuses …více

Klíčová slova
PA-IIL deriváty monosacharidů virtuální screening molekulární dokování reskórování vývoj softwaru monosaccharide derivatives virtual screening molecular docking rescoring software development
Zadání práce
Cílem práce je rozvinout stávající techniky virtuálního screeningu a to obzvláště v oblasti dokování testovaných ligandů do vybraných biomolekulárních systému.
Pokyny pro vypracování:
1. Vypracování rešerše - současný stav metod virtuálního screeningu a dockingu
2. Implementace nových metodik
3. Aplikace nově vyvinutých technik na vybraný biomolekulární systém

Seznam odborné literatury:
= odborná literatura dle vlastní literární rešerše
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
26. 5. 2014 13:42, RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703
Plný text práce
6,5 MB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
19. 6. 2014
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D., učo 9703
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Jan Brezovský, Ph.D.

Konzultant

Mgr. Jakub Štěpán, Ph.D.
abs FI MU, PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.