Bakalářská práce

Analýza ovlivnění hladiny exprese genů v transgenní linii Arabidopsis thaliana po začlenění T-DNA inzerce do genomu

Analysis of a gene expresion level caused by the T-DNA insertion in Arabidopsis thaliana transgenic line

Sabina Gomelská
Anotace

Široce využívanou a efektivní metodou pro charakterizaci funkce cílového genu v genomu se již před několika lety stala inzerce T-DNA. Řada účinných metod zajišťuje právě přenos cizorodých genů do rostlinných buněk. Jednou z nich je transformace pomocí Agrobacterium tumefaciens. Touto metodou byla včleněna T-DNA do genomu modelového organismu Arabidopsis thaliana, která ovlivila hladinu transkripce …více

Abstract

T-DNA insertion has become a widely used and effective method for characterisation of target gene functions several years ago. A number of effective methods provide transport of foreign gene into plant cells. One of these is Agrobacterium tumefaciens mediated transformation. Using this method the T-DNA insertion was introduced into the genome of model organism Arabidopsis thaliana. This insertion influenced …více

Klíčová slova
telomeráza AtTERT Arabidopsis thaliana T-DNA transgenní DNA regulace exprese úroveň transkripce telomerázová aktivita telomerase transgenic DNA regulation of the expression transcription level telomerase activity
Zadání práce
Výsledkem transformace rostlin pomocí Agrobacterium tumefaciens, která je oblíbenou metodou pro vnášení zájmových konstruktů, bývá inzerce T-DNA do genomu v náhodném místě. V případě konstruktů nesoucích reportérový gen (např. GUS, GFP) pak úspěšnost začlenění může být sledována pomocí analýzy exprese reportérového transgenu s využitím mikroskopických metod nebo na úrovni transkripce pomocí RT-qPCR. Exprese transgenu může být ovlivněna místem začlenění T-DNA, dokonce může být umlčena, a také obráceně, včlenění T-DNA do genomu může ovlivnit expresi přirozených genů, ať už jejich narušením vedoucím až k úplné ztrátě funkce (knock-down), což je nejčastější u T-DNA inzercí v exonové oblasti zasaženého genu, anebo ovlivněním jeho exprese v případě začlenění T-DNA v regulačních oblastech genů, ojediněle v oblasti intronu. Pokud není funkce zasaženého genu esenciální, nebo není pozorován výrazný fenotyp, zpravidla nebývá odhalena. Předmětem práce bude analýza transgenní linie Arabidopsis thaliana nesoucí konstrukt pAt336pMDC140 pomocí RT-qPCR s cílem ověření výsledků pilotního pokusu a jejich doplnění qTRAP analýzou pro další charakterizaci linie
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
22. 6. 2015 07:43, Mgr. Eva Sýkorová, CSc., učo 26127
Plný text práce
777,3 KB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Eva Sýkorová, CSc., učo 26127
ext NCBR PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.