V rámci vizualizace molekulárních dat, např. pro publikační účely, je v současné době kreslení průhledných reprezentací standardem. Diplomová práce se zaměří na urychlení vykreslovací pipeline aplikace CAVER Analyst, která nyní umožňuje vykreslování průhledných molekulárních povrchů pomocí tzv. Depth-Peeling algoritmu. Cílem práce je implementovat nový algoritmus, který bude založen na technice A-buffer, a provést srovnání stávajícího řešení s novou implementací. Text práce bude diskutovat výběr zvolené techniky a popíše provedenou implementaci. Srovnání stávající a nové implementace bude diskutovat kvalitu výsledného obrazu a možnost kombinace zvolené techniky s jinými vykreslovacími technikami, např. ray-casting. Součástí tohoto srovnání bude také měření a vzájemné porovnání výkonu.