Recentní studie zaměřené na analýzu střevního mikrobiomu pacientů, kteří trpí idiopatickými střevními záněty ukazují, že mikrobiom těchto pacientů má sníženou diverzitu a někteří zástupci mikroorganizmů zcela chybí. Jedním z těchto mikroorganizmů je anaerobní bakterie Faecalibacterium prausnitzii, která má zajímavé protizánětlivé vlastnosti a silný probiotický efekt. Tato bakterie je významným kandidátem stát se probiotikem další generace.
Bakalářská práce by měla ověřit informace publikované v zahraniční literatuře a to pomocí přímého kultivačního experimentu, tak analýzy mikrobiomu pomocí konvenční PCR a sekvenování nové generace (Illumina MiSeq - 16S rRNA). Student bude izolovat Faecalibacterium prausnitzii ze vzorků stolice zdravých dobrovolníků. DNA bude student izolovat pomocí komerčních kitů ze stolice zdravých dobrovolníků, případně srovná zastoupení tohoto mikroorganismu ve stolici pacientů trpících záněty střev (IBD).
Doporučená literatura: Odborné vědecké články z Web of Science, Scopus, Science Direct, Scholar Google apod. Více článků si studentka nalezne a stáhne z internetových databází. Jako klíčová slova v AJ lze užívat nejrůznější kombinace následujících: Faecalibacterium prausnitzii, probiotic, intestinal microbiom, bowel disease apod.