Diplomová práce

Studium dlouhých nekódujících RNA u pacientů s renálním karcinomem

Study of long non-coding RNAs in patients with renal cell carcinoma

Bc. Alexandra Kondelová
Anotace

Renální buněční karcinom (RCC) je nejčastějším nádorovým onemocněním ledvin, je typický chemo- a radiorezistencí a časným nástupem relapsu. V současnosti není možné dostatečně citlivě předikovat klinický průběh onemocnění, což vede k potřebě studia nových molekulárních biomarkerů. Tato práce byla zaměřena na studium dlouhých nekódujících RNA (lncRNA), skupinu potenciálních diagnostických a prognostických …více

Abstract

Renal cell carcinoma (RCC) is the most common kidney cancer, it is typical by its chemo- and radioresistence and early onset of relapse. In this moment, it is not possible to predict the clinical course of the disease sufficiently sensitively what leads to the need of studying new molecular biomarkers. This work was focused on a study of long noncoding RNAs (lncRNAs), a group of potential diagnostic …více

Zadání práce
Maligní nádory ledvin představují asi 3 % všech malignit. Nejčastějším typem nádoru v této skupině je renální karcinom (RCC), jehož mortalita v porovnání s jinými evropskými zeměmi dosahuje v České republice velmi vysokých hodnot (40 %). Renální karcinomy jsou často diagnostikovány až v pokročilých stádiích, vykazují vysokou míru tvorby metastáz a zároveň jsou charakteristické značnou chemorezistencí a radiorezistencí. Proto je v poslední době kladen důraz na výzkum nových diagnostických a prognostických markerů, stejně jako terapeutických molekul, které by cílily tento agresivní druh nádoru. Jednou z potenciálních možností v této sféře jsou dlouhé nekódující RNA (long non-coding RNAs – lncRNA) představující skupinu RNA dlouhých přibližně 200-10000 bp. Tyto nekódující RNA jsou zapojeny do regulace genové exprese, čímž hrají klíčovou roli v esenciálních procesech jako je buněčný růst, proliferace, buněčná diferenciace. Mechanismus účinky vykazuje značnou variabilitu – na cílové geny mohou působit přímo nebo např. pomocí remodelace chromatinu, modifikace histonů nebo modulace aktivity proteinů. Deregulovaná exprese některých lncRNA byla pozorována u mnoha onemocnění včetně nádorových, což naznačuje jejich zapojení do procesů maligní transformace. U renálního karcinomu bylo doposud popsáno jen několik lncRNA, které by mohly být zapojeny do rozvoje RCC. Většina lncRNA vystupuje jako onkogenny (MALAT1, KCNQ1OT1) popř. jako nádorové supresory (GAS5, H19). Některé studie také naznačují využití tkáňově specifických lncRNA jako diagnostických markerů (HIF1A-AS1, AS2). Cílem diplomové práce je analyzovat expresní profily vybraných lncRNA ve tkání pacientů s renálním karcinomem a následně porovnat hladiny exprese s vybranými klinicko-patologickými údaji (TNM klasifikace, histopatologie, přežití pacientů). Dlouhé nekódující RNA s diagnostickým či prognostickým potenciálem potom funkčně charakterizovat na stabilních buněčných liniích renálního karcinomu a popsat jejich zapojení do procesu proliferace, migrace, klonogenicity a regulace buněčného cyklu a apoptózy.
Práce zkontrolována:
12. 5. 2017 01:09, prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., učo 42891
Plný text práce
2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
slovenština slovenština
Termín obhajoby
6. 6. 2017
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Ondřej Slabý, Ph.D., učo 42891
BiolÚ Teorie LF MU

Oponenti

Autor posudku dosud neidentifikován.
Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Mgr. Jaroslav Juráček, Ph.D., učo 258883
MOnkII CMM CEITEC MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.