Bakalářská práce

Studium interakce proteinů rodiny p53 s DNA modifikovanou reaktivními skupinami pro kovalentní biokonjugace

A study of p53-family protein interactions with DNA modified with reactive groups for covalent bioconjugations

Eva Čechová
Anotace

V této práci jsme se zabývali přípravou specificky modifikovaných DNA pro následné biokonjugace s DNA-vazebnými proteiny rodiny p53. Pomocí enzymatické inkorporace (PEX) s využitím 2´-deoxycytidin trifosfátu s konjugovaným propargylvinylsulfonamidem (PVS) byly připraveny značené DNA substráty, které obsahovaly cíleně PVS-modifikovanou p53-vazebnou sekvenci. Radioaktivně značené DNA substráty byly inkubovány …více

Abstract

In this work we focused on the preparation of site specifically modified DNA for the following bioconjugation DNA-binding proteins of p53 family. Enzymatic incorporation (PEX) using 2´-deoxycitidine triphosphate with conjugated propargylvinylsulfonamide was used for preparation of DNA substrates bearing targeted PVS-modified p53-binding sequence. Radioactive labelled DNA substrates were incubated with …více

Klíčová slova
protein p53 protein p63 protein p73 biokonjugace enzymatická inkorporace vinylsulfonamid DNA Michaelova adice nukleosid trifosfát cystein bioconjugation enzymatic incorporation vinylsulfonamide Michael addition nucleoside triphosphate cysteine
Zadání práce
Chemicky modifikovaná DNA je osvědčeným nástrojem studia nukleotidových sekvencí a různých interakci DNA s dalšími molekulami, včetně proteinů vázajících se na DNA s různou mírou specificity k její nukleotidové sekvenci či konformaci. V naší laboratoři se zabýváme studiem modifikace DNA různými chemickými skupinami, včetně elektrochemicky aktivních značek, fluoroforů a reaktivních skupin umožňujících vytvoření kovalentní vazby s další molekulou. V rámci tohoto tématu budou testovány interakce nádorových supresorů rodiny p53 s DNA modifikovanou Michalovými akceptory, což jsou reaktivní skupiny snadno vytvářející kovalentní konjugáty s thiolovými skupinami cysteinových zbytků v proteinech. Bude zkoumán především vliv těchto skupin na přesnost rozpoznání modifikovaných cílových míst v DNA zmíněnými proteiny a bude porovnána účinnost konjugace modifikované DNA s centrálními doménami proteinu p53, p63 a p73.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
20. 5. 2014 16:24, doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
Plný text práce
2,3 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
4. 2. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Miroslav Fojta, CSc., učo 31900
NCBR PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

Konzultant

Mgr. Petr Orság, Ph.D., učo 21288
abs PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.