Diplomová práce

Studium heterodimerních stavů 14-3-3 proteinů pomocí fluorové NMR spektroskopie

Study of heterodimeric states of 14-3-3 proteins by fluorine NMR spectroscopy

Bc. Jana Novotná, učo 531076
Anotace

14-3-3 proteiny jsou ubikvitní regulační proteiny přítomné ve všech dosud studovaných eukaryotických organismech. Přestože nevykazují enzymatickou aktivitu, modulují funkci svých vazebných partnerů prostřednictvím protein–proteinových interakcí. U člověka je exprimováno sedm izoforem s tkáňově závislou hladinou exprese, přičemž více izoforem je obvykle exprimováno současně. Tyto proteiny vytvářejí …více

Abstract

14-3-3 proteins are ubiquitous regulatory proteins present in all eukaryotic organisms screened for their presence. Although they lack enzymatic activity, they modulate the function of their binding partners through protein–protein interactions. In humans, seven isoforms are expressed with tissue-dependent abundance, and multiple isoforms are typically co-expressed. These proteins form both homo- and …více

Klíčová slova
14-3-3 nukleární magnetická rezonance 19F NMR značení proteinů heterodimerizace 14-3-3 nuclear magnetic resonance protein labelling 14-3-3 heterodimerization
Zadání práce
14-3-3 proteiny jsou eukaryotické regulátory, zapojené do mnoha buněčných procesů. Pro jejich funkci je podstatný jejich dimerní charakter, umožňující jejich roli jako molekulární lešení. V savcích je známo sedm izoforem, které mohou tvořit homodimery a heterodimery. Strukturní a interakční vlastnosti 14-3-3 heterodimerů jsou na rozdíl od 14-3-3 homodimerů mnohem méně prostudované. Metoda 19F NMR je nadějnou metodou pro studium 14-3-3 proteinů. Cílem této diplomové práce je ověření aplikace 19F NMR spektroskopie na studium heterodimerního 14-3-3 proteinu ve směsi dvou izoforem 14-3-3 proteinů. Jmenovitě budou pomoci 19F NMR charakterizovány strukturní oligomerní vlastnosti vybraných 14-3-3 heterodimerů vůči vybraným fosforylovaným partnerům.

Cíle práce
Cílem této práce je aplikace 19F NMR spektroskopie na studium heterodimerního 14-3-3 proteinu. Student připraví chimérní protein s inkorporovaným 19F Trp pro simulaci chování čistého heterodimeru při jeho studiu pomocí 19F NMR a získaná data porovná s chováním směsi dvou výchozích izoforem. Bude ověřeno, že inkorporace 19F Trp neovlivní termostabilitu a interakční vlastnosti studovaných isoforem. Dále bude metoda aplikována na studium interakce s vazebnými partnery 14-3-3 proteinů.

Literatura
  • A. Kozeleková, A. Náplavová, T. Brom, N. Gašparik, J. Šimek, J. Houser and J. Hritz. Phosphorylated and Phosphomimicking Variants May Differ-A Case Study of 14-3-3 Protein. (2022), Frontiers in Chemistry. 10:835733. doi:10.3389/fchem.2022.835733.
  • Z. Trošanová, P. Louša, A. Kozeleková, T. Brom, N. Gašparik, J. Tungli, V. Weisová, E. Župa, G. Žoldák and J. Hritz. Quantitation of Human 14-3-3z Dimerization and the Effect of Phosphorylation on Dimer-monomer Equilibria. Journal of Molecular Biology. Elsevier, 2022, roč. 434, č. 7, s. 1-13. ISSN 0022-2836. doi:10.1016/j.jmb.2022.167479. 
  • N. G. Sharaf, A. Gronenborn. Chapter Four - 19F-Modified Proteins and 19F-Containing Ligands as Tools in Solution NMR Studies of Protein Interactions. (2015), Editor: Zvi Kelman, Methods in Enzymology, Academic Press, 565, 67-95. doi.org/10.1016/bs.mie.2015.05.014.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2026 12:45, doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
Plný text práce
1,4 MB / soubor PDF

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 13. 5. 2029.

Odůvodnění: Zveřejnění částí této závěrečné práce týkající se kapitol 3.1, 4., 5 a Supplement B je z důvodu dosud nepublikovaných dat odloženo do 13. 5. 2029.

Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
9. 6. 2026
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. RNDr. Mgr. Jozef Hritz, Ph.D., učo 107254
NCBR PřF MU

Oponent

Mgr. Jan Komárek, Ph.D., učo 175127
NCBR PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biomolekulární chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.