Diplomová práce

Hmotnostní spektrometrie v lipidomice cerebrálních organoidů

Mass spectrometry lipidomics of cerebral organoids

Bc. Vratislav Berka
Anotace

Hmotnostní spektrometrie je dominantní technikou v lipidomice, kde umožňuje citlivou simultánní analýzu stovek druhů lipidů. Lipidomika se zabývá studiem celkového lipidomu, případně specifickými třídami lipidů, čímž přináší nové poznatky do studia metabolismu lipidů nebo biomarkerů pro klinickou diagnostiku. Bioanalytické přístroje procházejí neustálým technickým vývojem, který umožňuje dosažení vyšší …více

Abstract

Mass spectrometry is the dominant technique in lipidomics as it allows the sensitive and simultaneous measurement of hundreds of lipid species. Lipidomics deals with the study of global lipidome or specific lipid classes, thus bringing new insights into the lipid metabolism or the biomarker for clinical diagnosis. Bioanalytical instruments are constantly undergoing technical advancement to enable high …více

Zadání práce
Cerebral organoids are three-dimensional in vitro cell cultures (often generated from pluripotent stem cells), consisting of various brain tissue cell types and representing the anatomical structures of the human brain. Organoids are used to model neurological diseases and dementia; however, their lipid composition requires an adequate methodology for characterization. Lipids are essential constituents of cellular membranes involved in vital biological functions, and their composition evolves during neurogenesis and aging. Mass spectrometry-based exploratory lipidomics is a powerful tool to characterize membrane lipids, potentially unraveling mechanisms of neurodegeneration in Alzheimer's disease (AD), the most common cause of dementia worldwide. Classical hypotheses study the aggregation of membrane proteins, especially beta-amyloid and tau-protein, which are a hallmark of Alzheimer's disease. However, the mechanism of pathogenesis and, thus, targets for the potential treatment of Alzheimer's disease remain elusive. The diploma thesis aims to apply modern analytical technology based on mass spectrometry to determine a wide range of membrane lipids. The goal is to develop a novel analytical approach to exploratory lipidomics applied to cerebral organoids or clinical samples. The results of the diploma thesis may contribute to understanding the mechanism of the pathogenesis of AD. Recent developments in analytical technology provide a unique opportunity to bring an urgently needed new perspective to AD research.
Práce zkontrolována:
19. 5. 2022 17:44, PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D., učo 238088
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
2. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

PharmDr. Zdeněk Spáčil, Ph.D., učo 238088
Biomark EnvChem RECETOX PřF MU

Oponent

Mgr. Kateřina Dadáková, Ph.D., učo 147047
ÚBioch Chem PřF MU

Konzultant

Darshak Chandulal Gadara, Ph.D.
Biomark EnvChem RECETOX PřF MU

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.