Diplomová práce

Studium interakce protopinových alkaloidů s G-kvadruplexy

Study of the interaction of protopine alkaloids with G-quadruplexes

Bc. Daniela Kratochvilová
Anotace

Tato diplomová práce se zaměřuje na studium protopinových alkaloidů a jejich vlivu na nekanonické struktury DNA. Cílem bylo porovnat účinky jednotlivých zástupců alkaloidů na vybrané oligonukleotidy (GG1, Tel22, TBA, ds26, DL40, Ckit2). Především se sledovala stabilita struktury po interakci s alkaloidy pomocí cirkulárního dichroismu, který byl použit pro zjištění topologie struktury a k měření teplot …více

Abstract

This thesis focuses on the study of protopine alkaloids and their effect on non-canonical DNA structures. The aim was to compare the effects of selected alkaloid on selected oligonucleotides (GG1, Tel22, TBA, ds26, DL40, Ckit2). In particular, the stability of the structure after interaction with alkaloids was investigated by circular dichroism, which was used to determine the topology of the structure …více

Klíčová slova
allokryptopin muramin korykavin protopin hunnemanin leptokarpin kryptopin DNA oligonukleotid G-kvadruplex cirkulární dichroismus teplota tání asociační konstanta stechiometrický poměr pKR+ vazba allocryptopine muramine corycavine protopine hunnemanine leptocarpine cryptopine oligonucleotide G-quadruplex circular dichroism melting point association constant interaction stoichiometry binding
Zadání práce
Studentka bude při zpracovávání této práce studovat interakci sedmi zástupců
protopinových alkaloidů s několika odlišnými strukturami G-kvadruplexů.
Hlavními částmi práce bude určení základních fluorescenčních vlastností
alkaloidů včetně stanovení hodnoty pKR+, stanovení stabilizačního vlivu
alkaloidů na vybrané struktury DNA a bližší popis mechanismu interakce mezi
alkaloidy a G-kvadruplexy. K tomu bude studentka využívat především CD,
fluorescenční a UV-VIS spektroskopie.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2025 09:33, doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D., učo 13423
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF

Upozornění:

Část závěrečné práce byla v souladu s § 47b zákona o vysokých školách skryta z důvodu překážky pro její zveřejnění do 15. 5. 2030.

Odůvodnění: Zveřejnění částí této závěrečné práce týkající se kapitol Výsledky, diskuze a experimentální část je z důvodu možného patentového řízení odloženo na dobu 3 let.

Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
12. 6. 2025
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

doc. Mgr. Petr Táborský, Ph.D., učo 13423
ÚChem Chem PřF MU

Oponent

RNDr. Mgr. Iveta Třísková, Ph.D., učo 175126
ÚChem Chem PřF MU

Konzultant

Mgr. Pavel Hannig
stud PřF MU

Literatura

  • GARGALLO, Raimundo; Anna AVIÑÓ; Ramon ERITJA; Petra JAROŠOVÁ; Stefania MAZZINI; Leonardo SCAGLIONI a Petr TÁBORSKÝ. Study of alkaloid berberine and its interaction with the human telomeric i-motif DNA structure. Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy. Oxford: Elsevier, 2021, roč. 248, March 2021, s. 1-12. ISSN 1386-1425. Dostupné z: https://doi.org/10.1016/j.saa.2020.119185.
  • JAROŠOVÁ, Petra; Pavel HANNIG; Kateřina KOLKOVÁ; Stefania MAZZINI; Eva TÁBORSKÁ; Raimundo GARGALLO; Gigliola BORGONOVO; Roberto ARTALI a Petr TÁBORSKÝ. Alkaloid Escholidine and Its Interaction with DNA Structures. BIOLOGY-BASEL. BASEL: MDPI, 2021, roč. 10, č. 12, s. 1-16. ISSN 2079-7737. Dostupné z: https://doi.org/10.3390/biology10121225.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Analytická chemie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.