Diplomová práce

Studium protein-proteinových interakcí pomocí kombinace afinitní purifikace a kvantitativní hmotnostní spektrometrie u bioloužicích bakterií

Study of protein-protein interactions using a combination of affinity purification and quantitative mass spectrometry in bioleaching bacteria

Bc. Marek Šťavík
Anotace

Tato diplomová práce se zabývá studiem protein-proteinových interakcí mezi proteiny zapojených v aerobním či anaerobním metabolismu u bioloužicích bakterií,konkrétně u acidofilní bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans. Praktická část byla zaměřena na Hip protein, který zřejmě slouží jako přenašeč elektronů v anaerobním metabolismu. Byla zoptimalizována metoda pro jeho imobilizaci na povrch paramagnetických …více

Abstract

This diploma thesis deals with the study of protein-protein interactions of proteins involved in aerobic or anaerobic metabolism in bioleaching bacteria, specifically in the acidophilic bacteria Acidithiobacillus ferrooxidans. The practical part was focused on Hip protein, which seems to serve as an electron carrier in anaerobic metabolism. A method for its immobilization on the surface of paramagnetic …více

Klíčová slova
bioloužicí bakterie Acidithiobacillus ferrooxidans protein-proteinové interakce Hip protein glutathion-vazebné proteiny energetický metabolismus bioleaching bacteria protein-protein interactions glutathione-binding proteins energy metabolism
Zadání práce
Současné metody studia interakčních partnerů cílových proteinů pomocí afinitní purifikace jsou značně omezeny při nízkém pH. Fyziologické pH periplasmy acidofilních chemolitotrofních bakterií, jež se využívají při biotechnologické extrakci kovů, je však okolo 2. Proto je studium důležitých periplazmatických a membránových proteinů velmi problematické. Jedním z přístupů afinitní purifikace je využití stabilní kovalentní imobilizace proteinu. Cíle: Optimalizace kovalentní imobilizace vybraných periplazmatických rekombinantních proteinů na různé matrice, které budou stabilní při nízkém pH. Takto imobilizované proteiny budou poté využity k identifikaci jejich interakčních partnerů pomocí kombinace afinitní purifikace a DIA-MS analýzy. Získané výsledky protein-proteinových interakčních sítí pomohou odhalit funkce studovaných proteinů a predikovat metabolické dráhy v biohydrometalurgických aplikacích.
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
19. 5. 2022 10:45, Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
Plný text práce
1,8 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
15. 6. 2022
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

Mgr. Jiří Kučera, Ph.D., učo 67570
ÚBioch Chem PřF MU

Oponent

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D., učo 13418
ÚBioch Chem PřF MU

Konzultant

doc. Ing. Martin Mandl, CSc., učo 1408
ÚBioch Chem PřF MU
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Plán
Biotechnologie

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.