Disertační práce

Charge calculation and Study of Electrostatic Interactions in Molecular Mechanics

RNDr. Radka Svobodová-Vařeková, učo 4056
Anotace

V rámci počítačové chemie je stabilita konformeru studované molekuly popsána potenciální enerií tohoto konformeru. Při výpočtu potenciální energie pomocí molekulové mechaniky je časově nejnáročnějším krokem výpočet van der Waalsovské a elektrostatické energie. Proto je oblast výpočtu těchto energií jedním z témat, na něž je zaměřena pozornost počítačových chemiků. V této práci bylo realizováno detailní …více

Abstract

Computational chemistry describes stability of a molecular conformation by its potential energy. In molecular mechanics, the most computationaly demanding parts of potential energy calculation are van der Waals and electrostatic energy calculations. Therefore, long-range electrostatic and van der Waals interactions have been for a long time in the center of attention in empirical methods of computational …více

Klíčová slova
van der Waals energy electrostatic energy particle mesh Ewald cutoff method charge distribution electronegativity equalization method atom-bond electronegativity equalization method optimization parallelization parallel virtual machine parameterization organohalogens organometals
Administrativní informace
Práce zkontrolována:
11. 10. 2008 12:57, (IS automaticky)
Plný text práce
793 KB / soubor PDF
Jazyk práce
angličtina angličtina
Termín obhajoby
4. 12. 2007
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
NCBR PřF MU

Oponenti

prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc., učo 1904
KPSK FI MU
Mgr. Michal Kutý, Ph.D.
Ústav fyzikální biologie Jihočeské univerzity, Nové Hrady
doc. RNDr. Michal Otyepka, Ph.D.
Katedra fyzikální chemie PřF UP Olomouc
Autor posudku dosud neidentifikován.
Autor posudku dosud neidentifikován.
Citovat tuto práci
Masarykova univerzita Přírodovědecká fakulta
Studijní program
Biochemie (čtyřleté)
Obor

Práce na příbuzné téma

Seznam prací, které mají shodná klíčová slova.

Podobné práce

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.

  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.

  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.

  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.

  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.