Diplomová práce

Aplikace shlukovacích metod na data klinických registrů

The application of clustering methods on data of clinical registries

Bc. Hana Švihálková, učo 208192
Anotace

V mnoha případech se biologové ptají, zda jimi sesbíraná data spadají do nějakých přirozených skupin a pokud ano, kolik takových skupin je a která pozorování spadají do které skupiny. Cílem této diplomové práce je příprava rešerše o metodách shlukové analýzy, otestování těchto metod v dostupném matematickém a statistickém softwaru a příprava metodiky a funkčního algoritmu pro vyhledání podobných či …více

Abstract

In a lot of situations biologists who collected some data ask, whether these observations belongs to some natural groups and if they do, how many groups are there and which observations belongs to some concrete group. The aim of this thesis is to prepare a background research about a methods of cluster analysis, to apply some of these methods to clinical registry in acceptable mathematical and statistical …více

Zadání práce
Data klinických registrů lze chápat jako soubory datových vektorů, které jsou rozmístěny ve vícerozměrném prostoru. Nejen při analýzách klinických dat, ale i při managementu sběru dat v klinických registrech je často vyžadováno buď rozdělení souboru pacientů do příbuzných podskupin, nebo dohledání nejbližších sousedů k vybranému pacientovi. Cílem diplomové práce je připravit metodiku a odladit algoritmus, který uvedené úkoly bude schopen řešit v reálném čase a bude snadno modifikovatelný pro nasazení v registrech provozovaných v systému TRIALDB.

Cíle diplomové práce:

  • Připravit přehlednou rešerši o metodách diskriminační a clusterové analýzy
  • Otestovat tyto metody v dostupném matematickém a statistickém SW, srovnání výhod a nevýhod
  • Připravit metodiku a funkční algoritmus pro shlukování podobných či stejných subjektů ve vybraném klinickém registru
  • Připravit algoritmus a jeho implementaci nad databází systému TRIALDB, který umožní vyhledat podobné či stejné subjekty ke zvolenému subjektu

Literatura

  • Fraley C, Raftery A. Model-based clustering, discriminant analysis, and density estimation. Journal of the American Statistical Association. 2002 JUN 2002;97(458):611-31.
  • Jayanthi J, Mallia R, Shiny S, Baiju K, Mathews A, Kumar R, et al. Discriminant Analysis of Autofluorescence Spectra for Classification of Oral Lesions In Vivo. Lasers in Surgery and Medicine. 2009 JUL 2009;41(5):345-52.
  • Nadkarni PM, Brandt C, Frawley S, Sayward FG, Einbinder R, Zelterman D, Schacter L, Miller PL. 1998. Managing attribute--value clinical trials data using the ACT/DB client-server database system. J Am Med Inform Assoc 5(2):139-151.
Práce zkontrolována:
23. 5. 2011 09:03, RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D., učo 11180
Plný text práce
1,1 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
13. 6. 2011
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D., učo 11180
IBA SpolP LF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.