Rotaviry jako enterální patogeny způsobující průjmy představují riziko zejména pro malé děti do 5 let věku. Rotavirové infekce dětí mohou způsobit vážnou dehydrataci organizmu, vyžadující hospitalizace. V zemích s nízkým hygienickým standardem však představují rotavirové infekce poměrně častou příčinu úmrtí malých dětí. U selat ve věku 4 týdnů, kdy jsou odstavena od prasnice, často dochází k poodstavovým průjmům, které mohou vést až k úhynu zvířat. Navíc byl popsán přenos prasečích rotavirů na člověka a vnik nových rekombinantních kmenů. Rotaviry jsou často detekovány také v trusu a střevním obsahu divokých prasat, kde vzhledem k chování charakteristickému pro tento živočišný druh může snadno dojít k infekci lidskými i prasečími rotaviry. Rotaviry divokých prasat navíc nejsou z důvodu obtížné dostupnosti vzorků často studovány, v naší laboratoři jsou vzorky dostupné díky spolupráci s Mendelovou univerzitou v Brně. Viry budou detekovány metodou reverzně transkripční PCR, pro detailní typizace bude využita sekvenační analýza genových segmentů kódujících významné povrchové virové proteiny VP4 a VP7, případně některé další genomové segmenty. Jedná se o velmi aktuální téma, začátek experimentálních prací je od října 2016 v Laboratoři molekulární epidemiologie virových nákaz Oddělení virologie VÚVeL Brno. Laboratoř je zaměřena na studium gastroenterálních patogenů člověka a hospodářsky významných zvířat včetně divoce žijících druhů z čelení Picornaviridae, Reoviridae, Coronaviridae aj. Vyžadujeme ochotu se intenzivně věnovat experimentům. Nabízíme praktické seznámení se s metodami molekulární virologie (zpracování vzorků biologického materiálu, extrakce nukleových kyselin, PCR, reverzně transkripční PCR, PCR v reálném čase, sekvenace) se zaměřením na diagnostiku virů včetně analýzy získaných dat.