Při řešení diplomové práce bude student/studentka analyzovat morfologii laminů typu A a B. Bude studována morfologie jaderných laminů během buněčné diferenciace a reparace DNA. Dále bude testován prostorový vztah laminů k různým kompartmentům buněčného jádra, jako jsou transkripční továrny nebo replikační, či reparační ohniska DNA. Dále se student zaměří na analýzu kinetiky jaderných laminů a to metodou FRAP (Fluorescence Recovery after Photobleaching) a bude testována potencionální interakce laminů s vybranými proteiny metodou FRET (Förster Resonance Energy Transfer). Ke studiu bude použit konfokální mikroskop s možnostmi aplikace metod FRAP and FRET. Dále student zvládne metody immunofluorescence a detekci hladin proteinů pomocí western blotů. Ke studiu budou použity nejen buňky s normálním statusem laminů typu A, ale i myší fibroblasty s vyblokovanou funkcí laminů typu A a na lamin vázajícího se proteinu LAP2. Tudíž student bude muset zvládnout základní techniky kultivace lidských a myších buněk. Student se zapojí do běžného chodu laboratoře oddělení Molekulární cytologie a cytometrie Biofyzikálního ústavu AVČR v Brně a bude platným členem týmu. Výsledkem jeho práce mohou být konferenční sdělení nebo publikace v odborném časopise. Galiová G, Bártová E, Raska I, Krejcí J, Kozubek S. 2008. Chromatin changes induced by lamin A/C deficiency and the histone deacetylase inhibitor trichostatin A. Eur J Cell Biol 87:291–303. Goldman RD, Shumaker DK, Erdos MR, Eriksson M, Goldman AE, Gordon LB, Gruenbaum Y, Khuon S, Mendez M, Varga R, Collins FS. 2004. Accumulation of mutant lamin A causes progressive changes in nuclear architecture in Hutchinson-Gilford progeria syndrome. Proc Natl Acad Sci USA 101:8963–8968. Piston DW, Kremers GJ. 2007. Fluorescent protein FRET: the good, the bad and the ugly. Trends Biochem Sci 32:407–414. Redwood AB, Gonzalez-Suarez I, Gonzalo S. 2011a. Regulating the levels of key factors in cell cycle and DNA repair: new pathways revealed by lamins. Cell Cycle 10:3652–3657. Redwood AB, Perkins SM, Vanderwaal RP, Feng Z, Biehl KJ, Gonzalez-Suarez I, Morgado-Palacin L, Shi W, Sage J, Roti-Roti JL, Stewart CL, Zhang J, Gonzalo S. 2011b. A dual role for A-type lamins in DNA double-strand break repair. Cell Cycle 10:2549–2560. Reddy S, Comai L. 2012. Lamin A, farnesylation and aging. Exp Cell Res 318:1–7. Shimi T, Pfleghaar K, Kojima S, Pack CG, Solovei I, Goldman AE, Adam SA, Shumaker DK, Kinjo M, Cremer T, Goldman RD. 2008. The A- and B-type nuclear lamin networks: microdomains involved in chromatin organization and transcription. Genes Dev 22:3409–3421. Shumaker DK, Dechat T, Kohlmaier A, Adam SA, Bozovsky MR, Erdos MR, Eriksson M, Goldman AE, Khuon S, Collins FS, Jenuwein T, Goldman RD. 2006. Mutant nuclear lamin A leads to progressive alterations of epigenetic control in premature aging. Proc Natl Acad Sci USA 103:8703–8708. Stixová L, Matula P, Kozubek S, Gombitová A, Cmarko D, Raška I, Bártová E. 2012. Trajectories and nuclear arrangement of PML bodies are influenced by A-type lamin deficiency. Biol Cell 104:418–432.