Cílem diplomové práce je vyvinout metodu pro urychlení vykreslování složitých molekulárních scén, která by umožnila jejich interaktivní prozkoumávání. Metoda bude navazovat na již existující přístup, který je součástí nástroje cellVIEW, vyvinutého ve vizualizační skupině na TU Wien. Právě v těsné spolupráci s touto skupinou bude tato diplomová práce realizována. Interaktivní přístupy k vizualizaci a průchodu komplexních molekulární scén jsou zásadní zejména v edukativní oblasti a dále při prezentaci výzkumných výsledků širokému publiku. V molekulární vizualizaci můžeme využít předpokladu, že molekulární modely se skládají z velkého množství sférických objektů reprezentujících jednotlivé atomy. Urychlovací techniky pak často využívají nahrazení geometrie tzv. billboardingem nebo, jako v případě cellVIEW, redukci počtu sfér, které je třeba v daném snímku vykreslit. Tento přístup využívá hierarchii objektů ve scéně, kdy se omezení pro množství vykreslovaných objektů přesouvá z atomů na celé molekuly. V rámci této diplomové práce bude vyvinut nový přístup, který dále posune limity stávajícího algoritmu integrovaného v nástroji cellVIEW. Nově navržený přístup bude posouvat výše uvedený princip dále a bude redukovat počet molekul v rámci vyšších struktur (např. virů). Algoritmus bude navržen tak, aby jej bylo rovněž možné rekurzivně aplikovat na hierarchickou organizaci objektů ve scéně. Algoritmus vhodně vyváží paměťovou zátěž a množství redukovaných objektů s ohledem na obsah scény.