Diplomová práce

Využití „cell free“ expresních systémů pro přípravu rekombinantních proteinových inhibitorů peptidáz Eudiplozoon nipponicum

The protein inhibitors of peptidases from Eudiplozoon nipponicum and their preparation in recombinant form by using the cell-free expression systems

Bc. Pavel Roudnický, učo 375907
Anotace

Tato práce je v návaznosti na bakalářskou práci zaměřena na funkční proteiny parazitických červů – helmintů. Konkrétně jsme se zaměřili na modelový organismus Eudiplozoon nipponicum, který je řazen do třídy Monogenea. Tato skupina parazitů nebyla dosud z hlediska jejich biochemie prakticky zkoumána. V rámci experimentální části této práce jsme se proto zabývali genovou expresí funkčních proteinů E …více

Abstract

This thesis is focused on functional proteins of parasitic worms – helminths. As an experimental model organism we used Eudiplozoon nipponicum, belonging into class Monogenea. From biochemical point of view, this groupe of parasites has not been investigated yet. Therefore we decided to express the E. nipponicum selected genes of functional proteins, serine peptidases – serpins. These molecules play …více

Zadání práce
Cell-free proteinová exprese má své počátky v 60. letech minulého století. Od té doby se metoda významně zdokonalila v mnoha směrech. Byly například vylepšeny buněčné extrakty, na kterých celá metoda stojí, a také byl optimalizován systém regenerace energie, nezbytný pro správný průběh reakce. Obé pomohlo dosáhnout o několik řádů vyšších proteinových výtěžků, než v počátcích, což dalo vzniknout komerčně dostupným kitům obsahujícím veškeré komponenty potřebné pro reakci. Mezi molekuly esenciální pro život nejen parazitů se řadí proteolytické enzymy – peptidázy. Tyto jsou u parazitických červů zapojeny např. do procesu trávení, imunomodulace hostitelské reakce či vyhýbání se imunitní odpovědi hostitele. Za účelem udržení proteolyticé rovnováhy je nutné, aby byl takový systém kontrolovatelný tzn. aby proteolýzu bylo možné např. tlumit účinkem inhibitorů peptidáz. Do oblasti našeho zájmu spadají především proteinové inhibitory cysteinových peptidáz (např. cystatiny) a serinových peptidáz (serpiny) modelového organismu Eudiplozoon nipponicum (rybí ektoparazit), který je podobně jako i celá třída Monogenea v tomto směru prozkoumán jen minimálně. Hlavní cíl: V navržené práci by měly být utříděny dosavadní poznatky související s možnostmi využití „klasických“ expresních systémů a jejich srovnání s možnostmi „cell-free“, zejména s ohledem na přípravu funkčních rekombinantních molekul – antigenů, aktivních enzymů a především inhibitorů. Dílčí cíle této práce jsou: 1. Zpracovat dostupnou literaturu zaměřenou na optimalizaci cell-free přípravy rekombinantních proteinů se zaměřením na proteiny parazitických červů. 2. Na základě známých sekvenčních dat vybrat pro cell-free expresi vhodné kandidáty ze skupiny inhibitorů peptidáz modelového organismu Eudiplozoon nipponicum (Monogenea) a některé z nich připravit v rekombinantní formě. 3. Získané proteinové inhibitory peptidáz molekulárně a biochemicky charakterizovat.
Práce zkontrolována:
18. 5. 2015 13:25, RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259
Plný text práce
4 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
4. 6. 2015
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259
Paraz ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.