Bakalářská práce

Možnosti „cell free“ expresních systémů pro přípravu rekombinantních proteinů parazitických červů

“Cell free” expression systems and their adoption for production of parasitic worms recombinant proteins

Pavel Roudnický, učo 375907
Anotace

Cell-free (CF) proteinová exprese má své počátky v 60. letech minulého století. Od té doby se metoda významně zdokonalila v mnoha směrech. Byly například vylepšeny buněčné extrakty, na kterých celá metoda stojí, a také byl optimalizován systém regenerace energie, nezbytný pro správný průběh reakce. Obé pomohlo dosáhnout o několik řádů vyšších proteinových výtěžků, než v počátcích, což dalo vzniknout …více

Abstract

Since 1960, the beginning of cell-free (CF) protein expression approaches, the method has been significantly improved in many ways. For example the cell extracts, has been optimized as well as an energy renewal system, which is very important for the proper function of CF expression. Both improvements helped to achieve considerably higher protein yield. Subsequently this initiated the production of …více

Zadání práce
Parazitičtí červi – helminti, jsou skupinou nepříbuzných bilaterálně souměrných protostomních živočichů, kteří v určité fázi ontogenetického vývoje parazitují v těle obratlovce. Mezi helminty jsou řazeni zejména zástupci neodermátnich platyhelmintů kmenů Nematoda – hlístice, Acanthocephala - vrtejši a tříd Trematoda - motolice, Cestoda - tasemnice, Monogenea – jednorodí. Mnozí z helmintů jsou původci závažných parazitárních onemocnění zvířat i člověka (např. schistosomóza a filarióza - monitorovány WHO). S postupným rozvojem moderních biologických vědních disciplín jako jsou molekulární biologie a bioinformatika dochází rychlému generování obrovských datových souborů např. genomů či proteomů shrnujících informace o množství molekul produkovaných různými organismy, včetně helmintů. Informací z jednotlivých analýz lze využít k vytipování molekul, jejichž následná experimentální charakterizace by mohla vést k pochopení některých zásadních biologických dějů nebo by mohla být využita v diagnostice či v boji s parazity – vakcíny, terapeutika. Za účelem navazující experimentální charakterizace jednotlivých proteinových molekul je často nezbytné vybrané molekuly připravit v rekombinantní formě, k čemuž lze využít různé typy prokaryotických (např. baktérie - Escherichia coli) či eukaryotických (např. kvasinky - Pichia pastoris) expresních systémů. Pro některé aplikace může být vhodné připravit rekombinantní proteinové molekuly bez použití živých buněk – „free cell“ expresní systémy, přičemž taková příprava může přinášet celou řadu výhod. Hlavní cíl: V navržené práci by měly být charakterizovány základní typy expresních systémů, včetně „cell free“ exprese a zhodnoceny jejich možnosti s ohledem na parazitické červy. Dílčí cíle této práce jsou: 1. Na základě dostupných informací zpracovat základní členění jednotlivých typů expresních systémů, definovat jejich výhody a nevýhody a pokusit se vytipovat nejvhodnější „cell free“ systém pro přípravu rekombinantních proteinů parazitických červů. 2. Experimentálně ověřit využitelnost konkrétního vybraného „cell free“ expresního systému pro přípravu rekombinantní formy zvoleného proteinu některého z modelových organismů – parazitických červů např. Trichinella spiralis, Eudiplozoon nipponicum, Fascioloides magna
Práce zkontrolována:
21. 5. 2013 10:08, RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259
Plný text práce
1,2 MB / soubor PDF
Jazyk práce
čeština čeština
Termín obhajoby
18. 6. 2013
Práce byla úspěšně obhájena

Vedoucí

RNDr. Martin Kašný, Ph.D., učo 11259
Paraz ÚBZ Biol PřF MU

Oponent

Autor posudku dosud neidentifikován.

  • Přidání souboru

    Soubor nebo složku lze nahrát pomocí tlačítka Přidat.
  • Další operace se soubory

    Podrobnosti lze zjistit označením příslušného řádku.
  • Pohled pro experty

    Pro častou práci je možné zvolit režim Více možností.
  • Vyhledávání souborů

    Vyhledávaný výraz můžete zadat přímo do adresního řádku.
  • Rychlý přístup k souborům

    Pomocí funkce Nedávné je možné se rychle vrátit k právě prohlíženým souborům. Oblíbené soubory je také možné označit Hvězdičkou.